\ [Errno -101 \] NetCDF：打开netcdf文件时出现HDF错误

Question

打开我的netcdf文件时出现此错误。该代码之前工作。 我该如何解决 ？

追溯（最近一次通话）：

文件“”，行1，在...

collect_vgt中第71行的文件“ file.py”返回xr.open_dataset（filename）

在open_dataset autoclose = autoclose中的文件“ /.../lib/python3.6/site-packages/xarray/backends/api.py”，行286

在打开的ds = opener（）中，文件“ /.../lib/python3.6/site-packages/xarray/backends/netCDF4_.py”，第275行

在_open_netcdf4_group ds = nc4.Dataset中的文件“ /.../lib/python3.6/site-packages/xarray/backends/netCDF4_.py”，第199行ds = nc4.Dataset（文件名，mode = mode，** kwargs）

netCDF4._netCDF4.Dataset中的文件“ netCDF4 / _netCDF4.pyx”，行2015。在里面

netCDF4._netCDF4._ensure_nc_success中的文件“ netCDF4 / _netCDF4.pyx”，行1636

OSError：[Errno -101] NetCDF：HDF错误：b'file.nc'

当我尝试使用h5py打开相同的netcdf文件时，出现此错误：

OSError：无法打开文件（此文件系统上的文件锁定已禁用（使用HDF5_USE_FILE_LOCKING环境变量进行覆盖），errno = 38，错误消息='...'）

Answer 1

您必须处于这种情况：

• 您的HDF5库已更新（1.10.1）（netcdf在后台使用HDF5）

• 您的文件系统不支持HDF5库使用的文件锁定。

为了读取您的hdf5或netcdf文件，您需要设置以下环境变量：

 HDF5_USE_FILE_LOCKING=FALSE

作为参考，它是在HDF5版本1.10.1中引入的，

添加了禁用SWMR文件锁定方案的机制。

当基础文件系统不支持文件
锁定或已禁用锁定时，HDF5 1.10.0（包括patch1）中使用的文件锁定调用将失败。要禁用所有文件
锁定操作，
可以将名为HDF5_USE_FILE_LOCKING 的环境变量设置为五个字符的字符串
“ FALSE”。这从根本上不会改变HDF5库的
操作（除了打开/创建初始文件之外，SWMR是无锁的），
但是用户在打开文件时必须更加小心。
为了避免使用有问题的访问模式（即：多个编写器）>设计了文件锁定来防止访问。

此外，更新了将文件锁定
操作将errno设置为ENOSYS 时发出的错误消息（通常在
禁用文件锁定时），以
更好地描述问题和可能的解决方法。

（DER，2016/10/26，HDFFV-9918）