如何调整 RMarkdown 页面大小以适应大图(未重新缩放的 igraph)

Gor*_*rka 3 r igraph r-markdown

我需要在 RMarkdown 文档中拟合一个大的 igraph 绘图,但是很多节点和标签重叠(与下图类似)。

在此输入图像描述

我认为使用 'rescale=FALSE' 参数可以工作,但问题是绘图大小大于页面大小,无论 Fig.height、fig.width 选项如何。

在此输入图像描述

您可以在下面看到一个可重现的示例(另存为 .Rmd 和 Knit):

---
output: pdf_document
---

# How to resize page to fit plot?
```{r pressure, echo=FALSE, fig.height=20, fig.width=20, message=FALSE, warning=FALSE}
library(igraph)
st <- make_star(500)
set.seed(100)
plot(st, vertex.size=10, vertex.label=NA, rescale=FALSE) 
```
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

有没有办法将页面大小调整为非重新缩放的 igraph?

Wil*_*ira 5

classoption您可以通过在 中添加 来调整页面大小YAML

但您也可以使用图大小和xlim()ylim()调整页面内的图,如此处的答案

---
output:
  pdf_document:
documentclass: article
classoption:
  - a1paper
---

# How to resize page to fit plot?
```{r pressure, echo=FALSE, fig.height=30, fig.width=40, message=FALSE, warning=FALSE}
library(igraph)
st <- make_star(500)
set.seed(100)
plot(st, vertex.size=10, ylim=c(3,5), xlim = c(-7, 15),vertex.label=NA, rescale=FALSE)
```
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

在此输入图像描述

  • 很棒的答案,使用 igraph“layout_as_tree”绘制决策树时非常有用的信息。你为我节省了很多源代码挖掘的时间 (2认同)