在csv文件中编写和加载表达式集

Question

在R中,可以使用编写生物传感器ExpressionSet到csv文件中csv.write.例如,使用可用作bioconductor包的标准膀胱填充数据,以下代码将csv文件写入当前工作的drectory:

library("bladderbatch")
data("bladderdata")
write.csv(bladderEset, "bladderEset.csv")

是否有一个工具可以将生成的csv文件读回到R中ExpressionSet？

如果没有,是否有一个ExpressionSet ? csvserialiser/deserialiser,它既可以将ExpressionSets输出为csv文件,也可以将csv文件作为ExpressionSets读取？

我问的原因是因为我需要用Python和Java代码ExpressionsSets互动,我可以很容易地用"CSV"文件,但不能与".rda",".CEL"或其他二进制文件.

Answer 1

如果您只想使用 R 和 python 与数据进行交互，请考虑将 ExpressionSet 保存为羽毛对象。