如何使用 Tidyr 在 Tidyverse 中转置 (t)

Mik*_*ike 8 r dplyr tidyr tidyverse

使用示例数据(底部),我想使用下面的代码对数据进行分组和汇总。在此之后,我想转置,但我被困在如何使用 tidyr 来实现这一点?

对于上下文,我试图重新创建一个使用 knitr::kable 在 Excel 中创建的现有表,因此我的以下代码的最终产品预计会破坏整洁原则。

例如:

library(tidyverse)

Df <- Df %>% group_by(Code1, Code2, Level) %>%
    summarise_all(funs(count = sum(!is.na(.))))
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我可以使用管道添加 t(.) ...

Df <- Df %>% group_by(Code1, Code2, Level) %>%
    summarise_all(funs(count = sum(!is.na(.)))) %>%
    t(.)
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或者我可以添加...

Df <- as.data.frame(t(Df)
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这两个选项都允许我转置,但我想知道是否有使用 tidyrgatherspread函数实现这一目标的 tidyverse 方法?我想对这个过程有更多的控制,还想删除“V1”、“V2”等,它们在使用转置 ( t)时显示为列名。

如何使用 tidyverse 实现这一目标?

示例代码:

Code1 <- c("H200","H350","H250","T400","T240","T600")
Code2 <- c("4A","4A","4A","2B","2B","2B")
Level <- c(1,2,3,1,2,3)
Q1 <- c(30,40,40,50,60,80)
Q2 <- c(50,30,50,40,80,30)
Q3 <- c(30,45,70,42,81,34)

Df <- data.frame(Code1, Code2, Level, Q1, Q2, Q3)
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Cur*_* F. 14

tidyverse 中的一般习惯用法是将gather()您的数据最大化,形成一个“长”数据框,每行一个测量值。然后,spread()可以将此长数据帧恢复为您最喜欢的“宽”格式。这个过程可以有效地转置数据:只是行名之外gather()所有标识符列,然后是行名。spread()

例如,这里是如何有效地转置mtcars

require(tidyverse)

mtcars %>% 
    rownames_to_column %>%
    gather(variable, value, -rowname) %>% 
    spread(rowname, value)
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您的数据没有 R 中理解的“行名称”,但Code1有效地用作行名称,因为它唯一标识数据的每一(原始)行。

Df1 <- Df %>% 
    group_by(Code1, Code2, Level) %>%
    summarise_all(funs(count = sum(!is.na(.)))) %>%
    gather(column, value, -Code1) %>%
    spread(Code1, value)
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tidyr 1.0 或更高版本的更新(2019 年末起)

新的pivot_wider()pivot_longer()功能现在比旧的(但仍受支持)gather()spread(). 因此,转置 mtcars 的首选方法可能是

require(tidyverse)

mtcars %>% 
    rownames_to_column() %>%
    pivot_longer(-rowname, 'variable', 'value') %>%
    pivot_wider(variable, rowname)
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  • 如果您的 data.frame 或 tibble 具有不同的数据类型,您可能必须首先将它们显式强制为一致的数据类型,例如使用 apply(mtcars, 2, as.character)。否则,pivot_longer 可能会导致错误。(适用于 mtcars,但一般情况下可能不适用)。 (2认同)