ValueError:使用序列设置数组元素

Question

这个Python代码:

import numpy as p

def firstfunction():
    UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray = []
    MeanOutputHeader=['TestID','ConditionName','FilterType','RRMean','HRMean',
                      'dZdtMaxVoltageMean','BZMean','ZXMean','LVETMean','Z0Mean',
                      'StrokeVolumeMean','CardiacOutputMean','VelocityIndexMean']
    dataMatrix = BeatByBeatMatrixOfMatrices[column]
    roughTrimmedMatrix = p.array(dataMatrix[1:,1:17])


    trimmedMatrix = p.array(roughTrimmedMatrix,dtype=p.float64)  #ERROR THROWN HERE


    myMeans = p.mean(trimmedMatrix,axis=0,dtype=p.float64)
    conditionMeansArray = [TestID,testCondition,'UnfilteredBefore',myMeans[3], myMeans[4], 
                           myMeans[6], myMeans[9], myMeans[10], myMeans[11], myMeans[12],
                           myMeans[13], myMeans[14], myMeans[15]]
    UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray.append(conditionMeansArray)
    secondfunction(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray)
    return

def secondfunction(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray):
    RRDuringArray = p.array(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray,dtype=p.float64)[1:,3]
    return

firstfunction()

抛出此错误消息:

File "mypath\mypythonscript.py", line 3484, in secondfunction
RRDuringArray = p.array(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray,dtype=p.float64)[1:,3]
ValueError: setting an array element with a sequence.

任何人都可以告诉我如何解决上面破坏的代码中的问题,以便它停止抛出错误消息？

---

编辑: 我做了一个打印命令来获取矩阵的内容,这是打印出来的:

UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray是:

[['TestID', 'ConditionName', 'FilterType', 'RRMean', 'HRMean', 'dZdtMaxVoltageMean', 'BZMean', 'ZXMean', 'LVETMean', 'Z0Mean', 'StrokeVolumeMean', 'CardiacOutputMean', 'VelocityIndexMean'],
[u'HF101710', 'PreEx10SecondsBEFORE', 'UnfilteredBefore', 0.90670000000000006, 66.257731979420001, 1.8305673000000002, 0.11750000000000001, 0.15120546389880002, 0.26870546389879996, 27.628261216480002, 86.944190346160013, 5.767261352345999, 0.066259118585869997],
[u'HF101710', '25W10SecondsBEFORE', 'UnfilteredBefore', 0.68478571428571422, 87.727887206978565, 2.2965444125714285, 0.099642857142857144, 0.14952476549885715, 0.24916762264164286, 27.010483303721429, 103.5237336525, 9.0682762747642869, 0.085022572648242867],
[u'HF101710', '50W10SecondsBEFORE', 'UnfilteredBefore', 0.54188235294117659, 110.74841107829413, 2.6719262705882354, 0.077705882352917643, 0.15051306356552943, 0.2282189459185294, 26.768787504858825, 111.22827075238826, 12.329456404418824, 0.099814258468417641],
[u'HF101710', '75W10SecondsBEFORE', 'UnfilteredBefore', 0.4561904761904762, 131.52996981880955, 3.1818159523809522, 0.074714285714290493, 0.13459344175047619, 0.20930772746485715, 26.391156337028569, 123.27387909873812, 16.214243779323812, 0.1205685359981619]]

对我来说看起来像一个5行乘13列矩阵,但是当通过脚本运行不同的数据时,行数是可变的.有了这个我在这里添加的相同数据.

编辑2:但是,脚本抛出错误.所以我认为你的想法不能解释这里发生的问题.谢谢你.还有其他想法吗？

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编辑3:

仅供参考,如果我更换此问题代码行:

    RRDuringArray = p.array(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray,dtype=p.float64)[1:,3]

改为:

    RRDuringArray = p.array(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray)[1:,3]

然后脚本的该部分工作正常而不会抛出错误,但然后这行代码进一步下线:

p.ylim(.5*RRDuringArray.min(),1.5*RRDuringArray.max())

抛出此错误:

File "mypath\mypythonscript.py", line 3631, in CreateSummaryGraphics
  p.ylim(.5*RRDuringArray.min(),1.5*RRDuringArray.max())
TypeError: cannot perform reduce with flexible type

因此,您可以看到我需要指定数据类型才能在matplotlib中使用ylim,但是指定数据类型会抛出发起此帖子的错误消息.

Answer 1

从你向我们展示的代码中,我们唯一可以告诉你的是你试图从一个形状不像多维数组的列表中创建一个数组.例如

numpy.array([[1,2], [2, 3, 4]])

要么

numpy.array([[1,2], [2, [3, 4]]])

将产生此错误消息,因为输入列表的形状不是可以转换为多维数组的(通用)"框".所以可能UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray包含不同长度的序列.

编辑:此错误消息的另一个可能原因是尝试使用字符串作为类型数组中的元素float:

numpy.array([1.2, "abc"], dtype=float)

这就是你根据编辑尝试的内容.如果你真的想要一个包含字符串和浮点数的NumPy数组,你可以使用dtype object,它允许数组保存任意Python对象:

numpy.array([1.2, "abc"], dtype=object)

在不知道你的代码应该完成什么的情况下,我无法判断这是否是你想要的.

Answer 2

Python ValueError:

ValueError: setting an array element with a sequence.

完全意味着它所说的,你试图将一系列数字塞进一个数字槽中.它可以在各种情况下抛出.

1.当您传递python元组或列表以解释为numpy数组元素时:

import numpy

numpy.array([1,2,3])               #good

numpy.array([1, (2,3)])            #Fail, can't convert a tuple into a numpy 
                                   #array element


numpy.mean([5,(6+7)])              #good

numpy.mean([5,tuple(range(2))])    #Fail, can't convert a tuple into a numpy 
                                   #array element


def foo():
    return 3
numpy.array([2, foo()])            #good


def foo():
    return [3,4]
numpy.array([2, foo()])            #Fail, can't convert a list into a numpy 
                                   #array element

2.尝试将numpy数组长度> 1塞入一个numpy数组元素:

x = np.array([1,2,3])
x[0] = np.array([4])         #good



x = np.array([1,2,3])
x[0] = np.array([4,5])       #Fail, can't convert the numpy array to fit 
                             #into a numpy array element

正在创建一个numpy数组,numpy不知道如何将多值元组或数组填充到单个元素槽中.它期望你给它的任何东西评估为单个数字,如果没有,Numpy会回答它不知道如何用序列设置数组元素.

Answer 3

在我的情况下,我在Tensorflow中得到了这个错误,原因是我试图提供不同长度或序列的数组:

例如:

import tensorflow as tf

input_x = tf.placeholder(tf.int32,[None,None])



word_embedding = tf.get_variable('embeddin',shape=[len(vocab_),110],dtype=tf.float32,initializer=tf.random_uniform_initializer(-0.01,0.01))

embedding_look=tf.nn.embedding_lookup(word_embedding,input_x)

with tf.Session() as tt:
    tt.run(tf.global_variables_initializer())

    a,b=tt.run([word_embedding,embedding_look],feed_dict={input_x:example_array})
    print(b)

如果我的数组是:

example_array = [[1,2,3],[1,2]]

然后我会得到错误:

ValueError: setting an array element with a sequence.

但如果我做填充然后:

example_array = [[1,2,3],[1,2,0]]

现在它正在运作.

Answer 4

就我而言，问题是另一个问题。我正在尝试将 int 列表列表转换为数组。问题是有一个列表的长度与其他列表不同。如果你想证明它，你必须这样做：

print([i for i,x in enumerate(list) if len(x) != 560])

就我而言，长度参考是 560。

Answer 5

对于在Numpy中遇到类似问题的人，一个非常简单的解决方案是：

定义dtype=object限定的阵列用于向它分配值时。例如：

out = np.empty_like(lil_img, dtype=object)