无法执行'x86_64-conda_cos6-linux-gnu-gcc':没有这样的文件或目录(pysam安装)

Question

我正在尝试安装pysam.

在执行之后:

python path/to/pysam-master/setup.py build

产生此错误:

unable to execute 'x86_64-conda_cos6-linux-gnu-gcc': No such file or directory
error: command 'x86_64-conda_cos6-linux-gnu-gcc' failed with exit status 1

有类似的线程,但它们似乎都解决了问题assumig administriator权利,我没有.有办法安装所需的文件吗？

免责声明:这个问题来自我以前的一篇文章. 手动安装pysam错误:"ImportError:没有模块命名版本" 但是由于它可能需要不同的方法,我把它作为自己的问题.

Answer 1

看起来Anaconda有一个新版本(4.3.27),它将C编译器路径设置为一个不存在的可执行文件(这是一个非常令人尴尬的错误;我相信他们很快就会修复它).我使用最新的Miniconda进行了pip安装有类似的问题,我使用4.3.21版本修复并确保我没有做类似的事情conda update conda.

请参阅https://repo.continuum.io/miniconda/,其中包含发布日期和版本.

Answer 2

如果使用conda安装了R,那么在安装某些R软件包时也会收到相同的错误(就像我一样).

然后通过执行以下conda install gxx_linux-64命令安装包:使该命令可用.

资料来源:https: //github.com/RcppCore/Rcpp/issues/770#issuecomment-346716808