Yan*_*ltz 6 r shiny networkd3 d3heatmap htmlwidgets
我正在开发一个 R 闪亮应用程序,它使用多个 html 小部件,特别是networkD3、d3heatmap和chorddiag。
这些小部件单独工作正常。但是,在同一页面中使用它们会在它们应该出现的地方留下空白。
这是显示错误的可重现代码。在 UI 中注释绘图行,您将看到绘图出现和消失..
我非常感谢你的帮助!
# libraries
library(shiny)
library(d3heatmap)
library(chorddiag)
library(networkD3)
# Server
server <- function(input, output) {
# create heatmap
output$heatmap <- renderD3heatmap({
d3heatmap(mtcars, scale = "column", colors = "Spectral")
})
# create chord diagram
output$chord <- renderChorddiag({
m <- matrix(c(11975, 5871, 8916, 2868,1951, 10048, 2060, 6171, 8010, 16145, 8090, 8045,1013, 990, 940, 6907),
byrow = TRUE, nrow = 4, ncol = 4)
haircolors <- c("black", "blonde", "brown", "red")
dimnames(m) <- list(have = haircolors, prefer = haircolors)
groupColors <- c("#000000", "#FFDD89", "#957244", "#F26223")
chorddiag(m, groupColors = groupColors, groupnamePadding = 20)
})
# create sankey
output$sankey <- renderSankeyNetwork({
nodes=data.frame(ID=c("A","B","C","D","E"))
links=data.frame(source=c(1,2,3), target=c(3,4,4), value=c(12,15,29))
sankeyNetwork(Links = links, Nodes = nodes, Source = "source", Target = "target", Value = "value", NodeID = "ID")
})
}
# Ui
ui <- fluidPage(
sidebarLayout(
sidebarPanel("shiny shines"),
mainPanel(
# Comment these lines and you will see charts appear / disappear.
d3heatmapOutput("heatmap"),
chorddiagOutput("chord"),
sankeyNetworkOutput("sankey")
)
)
)
shinyApp(ui = ui, server = server)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
networkD3
2017 年 2 月在版本 0.3中更新为 D3v4 ,该版本与 D3 的 v3 版本不兼容,而 D3 似乎chorddiag
正在d3heatmap
使用。htmlwidgets
,它是驱动上述包的底层包,仅使用依赖项的最新版本,因此使用同一库的冲突版本的 htmlwidgets 不能同时工作。检查此处以获取有关此问题的讨论的起点。
你有一些可能的选择,尽管它们都不是很好......
恢复networkD3
到 < 0.3 的版本,以便它也使用 D3v3
为chorddiag
开发者和d3heatmap
开发者升级到D3v4的游说
游说htmlwidgets
开发人员想出一种强大的方法来处理 JavaScript 依赖项冲突