如何在R包中的函数中使用数据？

Question

我目前正在为R包编写函数。此功能旨在实现的部分目的是（a）将数据作为输入，并且（b）根据可接受值的列表检查其某一列。

这些可接受的价值是从另一个组织给我的​​。它们位于.csv文件中。我想做的是加载此.csv文件，并将其用作检查来自用户的列是否具有有效值的参考。

例如，假设用户具有以下数据：

set.seed(1839)
user <- data.frame(x=sample(letters,10),
                   y=rnorm(10))
user

   x          y
1  v -0.7025836
2  p -1.4586245
3  f  0.1987113
4  y  1.0544690
5  o -0.7112214
6  m  0.2956671
7  b  0.3016737
8  a -0.0945271
9  x -0.2790357
10 c  0.1681388

.csv包含许多（有用的）列，但目前我只关心一个（z）：

ref <- data.frame(z=letters[1:4], a=rnorm(4), b=(rnorm(4)))
ref

  z          a          b
1 a -0.3563105  1.4536406
2 b  1.6841862  1.3232985
3 c  1.3073516 -0.6978598
4 d  0.4352904 -0.3971175

我想运行的代码是（注意：我没有library在实际函数中调用，为简单起见，我只是在这里做）：

library(dplyr)
valid_values <- ref %>%
  select(z) %>% 
  unname() %>% 
  unlist() %>% 
  as.character()

summary <- user %>% 
  mutate(x_valid=ifelse(x %in% valid_values, TRUE, FALSE))

summary告诉我xin user中哪些值有效：

   x          y x_valid
1  v -0.7025836   FALSE
2  p -1.4586245   FALSE
3  f  0.1987113   FALSE
4  y  1.0544690   FALSE
5  o -0.7112214   FALSE
6  m  0.2956671   FALSE
7  b  0.3016737    TRUE
8  a -0.0945271    TRUE
9  x -0.2790357   FALSE
10 c  0.1681388    TRUE

现在，我该用什么替换ref功能代码？我应该在哪里将这些数据存储在我的包裹中？如何加载？我应该隐瞒什么类型的文件？

该函数应类似于：

x_check <- function(data) {

  # get valid values
  valid_values <- ??? %>%
    select(z) %>% 
    unname() %>% 
    unlist() %>% 
    as.character()

  # compare against valid values
  return(
    data %>% 
    mutate(x_valid=ifelse(x %in% valid_values, TRUE, FALSE))
  )
}

我该???用什么代替来获取数据？我不太在乎用户是否能够看到ref我要加载的数据。

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我正在devtools::load_all("directory/for/my/package")测试我的包裹。相关会话信息：

R version 3.4.0 (2017-04-21)
Platform: x86_64-redhat-linux-gnu (64-bit)
Running under: Red Hat Enterprise Linux Server 7.3 (Maipo)

other attached packages:
[1] roxygen2_6.0.1             devtools_1.13.2

Answer 1

我想出来了，以防万一将来有人遇到这个。我是如何做到这一点的，只是从/data函数内的本地环境中的文件中加载数据：

x_check <- function(data) {

  # get reference data
  data("ref", envir=environment())

  # get valid values
  valid_values <- ref %>%
    select(z) %>% 
    unname() %>% 
    unlist() %>% 
    as.character()

  # compare against valid values
  return(
    data %>% 
    mutate(x_valid=ifelse(x %in% valid_values, TRUE, FALSE))
  )
}