Nit*_*mar 2 cluster-analysis machine-learning k-means scikit-learn
我基本上是使用 mini_batch_kmeans 和 kmeans 算法对我的一些文档进行聚类。我只是按照教程是 scikit-learn 网站,其链接如下:http : //scikit-learn.org/stable/auto_examples/text/document_clustering.html
他们正在使用一些方法进行矢量化,其中之一是 HashingVectorizer。在 hashingVectorizer 中,他们使用 TfidfTransformer() 方法制作管道。
# Perform an IDF normalization on the output of HashingVectorizer
hasher = HashingVectorizer(n_features=opts.n_features,
stop_words='english', non_negative=True,
norm=None, binary=False)
vectorizer = make_pipeline(hasher, TfidfTransformer())
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一旦这样做,我从中得到的矢量化器就没有方法 get_feature_names()。但是由于我将它用于聚类,因此我需要使用此“get_feature_names()”来获取“条款”
terms = vectorizer.get_feature_names()
for i in range(true_k):
print("Cluster %d:" % i, end='')
for ind in order_centroids[i, :10]:
print(' %s' % terms[ind], end='')
print()
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我该如何解决这个错误?
我的整个代码如下所示:
X_train_vecs, vectorizer = vector_bow.count_tfidf_vectorizer(_contents)
mini_kmeans_batch = MiniBatchKmeansTechnique()
# MiniBatchKmeans without the LSA dimensionality reduction
mini_kmeans_batch.mini_kmeans_technique(number_cluster=8, X_train_vecs=X_train_vecs,
vectorizer=vectorizer, filenames=_filenames, contents=_contents, is_dimension_reduced=False)
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计数矢量化器通过 tfidf 进行管道传输。
def count_tfidf_vectorizer(self,contents):
count_vect = CountVectorizer()
vectorizer = make_pipeline(count_vect,TfidfTransformer())
X_train_vecs = vectorizer.fit_transform(contents)
print("The count of bow : ", X_train_vecs.shape)
return X_train_vecs, vectorizer
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mini_batch_kmeans 类如下:
class MiniBatchKmeansTechnique():
def mini_kmeans_technique(self, number_cluster, X_train_vecs, vectorizer,
filenames, contents, svd=None, is_dimension_reduced=True):
km = MiniBatchKMeans(n_clusters=number_cluster, init='k-means++', max_iter=100, n_init=10,
init_size=1000, batch_size=1000, verbose=True, random_state=42)
print("Clustering sparse data with %s" % km)
t0 = time()
km.fit(X_train_vecs)
print("done in %0.3fs" % (time() - t0))
print()
cluster_labels = km.labels_.tolist()
print("List of the cluster names is : ",cluster_labels)
data = {'filename':filenames, 'contents':contents, 'cluster_label':cluster_labels}
frame = pd.DataFrame(data=data, index=[cluster_labels], columns=['filename', 'contents', 'cluster_label'])
print(frame['cluster_label'].value_counts(sort=True,ascending=False))
print()
grouped = frame['cluster_label'].groupby(frame['cluster_label'])
print(grouped.mean())
print()
print("Top Terms Per Cluster :")
if is_dimension_reduced:
if svd != None:
original_space_centroids = svd.inverse_transform(km.cluster_centers_)
order_centroids = original_space_centroids.argsort()[:, ::-1]
else:
order_centroids = km.cluster_centers_.argsort()[:, ::-1]
terms = vectorizer.get_feature_names()
for i in range(number_cluster):
print("Cluster %d:" % i, end=' ')
for ind in order_centroids[i, :10]:
print(' %s' % terms[ind], end=',')
print()
print("Cluster %d filenames:" % i, end='')
for file in frame.ix[i]['filename'].values.tolist():
print(' %s,' % file, end='')
print()
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Pipeline 没有 get_feature_names() 方法,因为为 Pipeline 实现此方法并不简单 - 需要考虑所有管道步骤才能获取功能名称。见https://github.com/scikit-learn/scikit-learn/issues/6424,https://github.com/scikit-learn/scikit-learn/issues/6425,等等-有很多相关的票和几次尝试修复它。
如果您的管道很简单(TfidfVectorizer 后跟 MiniBatchKMeans),那么您可以从 TfidfVectorizer 获取特征名称。
如果您想使用 HashingVectorizer,它会更复杂,因为 HashingVectorizer 设计时不提供功能名称。HashingVectorizer 不存储词汇,而是使用散列 - 这意味着它可以应用于在线设置,并且它不需要任何 RAM - 但权衡正是你没有得到特征名称。
尽管如此,仍然可以从 HashingVectorizer 获取特征名称;为此,您需要将其应用于文档样本,存储哪些散列对应于哪些单词,并通过这种方式了解这些散列的含义,即特征名称是什么。可能会有冲突,所以不可能 100% 确定特征名称是正确的,但通常这种方法可以正常工作。这种方法是在eli5库中实现的;有关示例,请参见http://eli5.readthedocs.io/en/latest/tutorials/sklearn-text.html#debugging-hashingvectorizer。你将不得不做这样的事情,使用InvertableHashingVectorizer:
from eli5.sklearn import InvertableHashingVectorizer
ivec = InvertableHashingVectorizer(vec) # vec is a HashingVectorizer instance
# X_sample is a sample from contents; you can use the
# whole contents array, or just e.g. every 10th element
ivec.fit(content_sample)
hashing_feat_names = ivec.get_feature_names()
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然后你可以使用hashing_feat_names你的特征名称,因为 TfidfTransformer 不会改变输入向量的大小,只是缩放相同的特征。