使用predict.glm(...,type =“ response”,se.fit = TRUE)返回哪些标准错误?

Ale*_*lex 4 statistics regression r confidence-interval glm

在执行逻辑回归后,我将使模型适合这个出色示例中提供的数据,该示例如何计算响应的95%置信区间:

foo <- mtcars[,c("mpg","vs")]; names(foo) <- c("x","y")
mod <- glm(y ~ x, data = foo, family = binomial)
preddata <- with(foo, data.frame(x = seq(min(x), max(x), length = 100)))
preds <- predict(mod, newdata = preddata, type = "link", se.fit = TRUE)

critval <- 1.96 ## approx 95% CI
upr <- preds$fit + (critval * preds$se.fit)
lwr <- preds$fit - (critval * preds$se.fit)
fit <- preds$fit

fit2 <- mod$family$linkinv(fit)
upr2 <- mod$family$linkinv(upr)
lwr2 <- mod$family$linkinv(lwr)
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现在,我的问题来自这样一个事实,即您可以直接通过以下方式直接获得响应

predict(..., type = 'response', se.fit = TRUE)
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没有改变

predict(..., type = 'link', se.fit = TRUE)
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但是,这会产生不同的标准误差。这些误差是什么?它们可以直接用于计算拟合响应值的置信区间吗?

相关的代码predict.glm是这样的:

switch(type, response = {
    se.fit <- se.fit * abs(family(object)$mu.eta(fit))
    fit <- family(object)$linkinv(fit)
}, link = , terms = )
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并比较输出:

preds_2 <- predict(mod, newdata = preddata, type = "response", se.fit = TRUE)


> head(preds_2$fit)
         1          2          3          4          5          6 
0.01265744 0.01399994 0.01548261 0.01711957 0.01892627 0.02091959 

> head(preds_2$se.fit)
         1          2          3          4          5          6 
0.01944681 0.02098841 0.02263473 0.02439022 0.02625902 0.02824491 
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从上述内容转到以下内容似乎不太明显:

> head(fit2)
         1          2          3          4          5          6 
0.01265744 0.01399994 0.01548261 0.01711957 0.01892627 0.02091959 
> head(upr2)
        1         2         3         4         5         6 
0.2130169 0.2184891 0.2240952 0.2298393 0.2357256 0.2417589 
> head(lwr2)
           1            2            3            4            5            6 
0.0006067975 0.0007205942 0.0008555502 0.0010155472 0.0012051633 0.0014297930 
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李哲源*_*李哲源 6

如果您看一下?family,您将看到它$mu.etamuover 的导数eta(即,反向链接函数的导数)。因此,se.fit = TRUE对于type = "response"给出真实标准误差的一阶近似值。这称为“增量法”。

当然,由于反向链接函数通常是非线性的,因此置信区间在拟合值附近不是对称的。因此,获得链路规模上的置信区间,然后将其映射回响应规模是正确的方法。

  • 谢谢,我希望他们能从你的第一段中取出一行并将其放入`?predict.glm` 中的文档中。 (2认同)