当数据具有NaN时,在matplotlib中的线图中绘制阴影不确定区域

Question

我想要一个看起来像这样的情节:

我想用matplotlib做这个:

fig, ax = plt.subplots()

with sns.axes_style("darkgrid"):
    for i in range(5):
        ax.plot(means.ix[i][list(range(3,104))], label=means.ix[i]["label"])
        ax.fill_between(means.ix[i][list(range(3,104))]-stds.ix[i][list(range(3,104))], means.ix[i][list(range(3,104))]+stds.ix[i][list(range(3,104))])
    ax.legend()

我希望阴影区域与中心的线条颜色相同.但是现在,我的问题是means有一些NaN并且fill_between不接受.我收到了错误

TypeError:输入类型不支持ufunc'isfinite',根据强制转换规则''safe',输入无法安全地强制转换为任何支持的类型

关于如何实现我想要的任何想法？该解决方案不需要使用matplotlib,只要它可以绘制我的一系列点与多个系列的不确定性.

Answer 1

好。因此，问题之一是dtype我的数据是否存在object，float并且fill_between在查看数字是否有限时导致失败。我最终设法做到了（a）转换为float，然后（b）解决颜色不确定性和线条匹配的问题，使用调色板。所以我有：

import seaborn as sns
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import pandas as pd
fig, ax = plt.subplots()
clrs = sns.color_palette("husl", 5)
with sns.axes_style("darkgrid"):
    epochs = list(range(101))
    for i in range(5):
        meanst = np.array(means.ix[i].values[3:-1], dtype=np.float64)
        sdt = np.array(stds.ix[i].values[3:-1], dtype=np.float64)
        ax.plot(epochs, meanst, label=means.ix[i]["label"], c=clrs[i])
        ax.fill_between(epochs, meanst-sdt, meanst+sdt ,alpha=0.3, facecolor=clrs[i])
    ax.legend()
    ax.set_yscale('log')

这给了我以下结果：

Answer 2

NaNs您可以简单地从DataFrame 中删除means并绘制结果数据框吗？

在下面的示例中，我试图接近您的结构，我有一个means数据帧，周围散布着一些数据帧NaN。我想stdsDataFrame 可能位于NaN相同的位置，但在这种情况下，这并不重要，我删除了NaNfrommeans来获取temp_means，并使用留下的索引temp_means来提取 std 值stds。

NaN这些图显示了删除s之前（顶部）和之后（底部）的结果

x = np.linspace(0, 30, 100)
y = np.sin(x/6*np.pi)
error = 0.2

means = pd.DataFrame(np.array([x,y]).T,columns=['time','mean'])
stds = pd.DataFrame(np.zeros(y.shape)+error)

#sprinkle some NaN in the mean
sprinkles = means.sample(10).index
means.loc[sprinkles] = np.NaN


fig, axs = plt.subplots(2,1)

axs[0].plot(means.ix[:,0], means.ix[:,1])
axs[0].fill_between(means.ix[:,0], means.ix[:,1]-stds.ix[:,0], means.ix[:,1]+stds.ix[:,0])

temp_means = means.dropna()

axs[1].plot(temp_means.ix[:,0], temp_means.ix[:,1])
axs[1].fill_between(temp_means.ix[:,0], temp_means.ix[:,1]-stds.loc[temp_means.index,0], temp_means.ix[:,1]+stds.loc[temp_means.index,0])


plt.show()