R 中的简单密码子到氨基酸哈希

Question

我想创建一个 R 脚本，其中有一个哈希表，我可以在其中查找密码子并获取其关联的氨基酸。例如，

library(hash)

hashTable <- hash(...) #insert all codon-to-amino acid pairs
hashTable['TTT']

将返回

[1] Phe

有谁知道我会怎么做？或者也许我可以安装一个包（Bioconductor？）让这更容易？

Answer 1

对于这个问题，几乎可以肯定有一个预先存在的解决方案。一种可能性是 Bioconductor 的Biostrings，例如：

library(Biostrings)
GENETIC_CODE[["ATG"]]
[1] "M"