安装了多个版本的 R - 终端从 RStudio 启动错误/不同的 R

Question

我正在尝试编译我的 R 包，并意识到我的 Mac 上安装了多个版本的 R，这给我带来了困难。当我从终端运行“which R”时，我收到：

Home$ which R
/Users/Home/anaconda2/bin/R

Home$ R
R version 3.2.2 (2015-08-14) -- "Fire Safety"

但是，当我从应用程序文件夹启动 RStudio 并在控制台中键入“版本”时，我得到以下信息：

> version
               _                           
platform       x86_64-apple-darwin13.4.0   
arch           x86_64                      
os             darwin13.4.0                
system         x86_64, darwin13.4.0        
status                                     
major          3                           
minor          3.2                         
year           2016                        
month          10                          
day            31                          
svn rev        71607                       
language       R                           
version.string R version 3.3.2 (2016-10-31)
nickname       Sincere Pumpkin Patch      

所以我在 RStudio 上有 3.3.2（我想要编译我的包的版本），当我在终端中输入 R 时，来自 anaconda 的 3.2.2 正在终端中启动。

我怎样才能解决这个问题？从终端启动时，是否必须更改路径才能找到正确的 R 版本？如何找到正确的路径？

谢谢！

Answer 1

我敢打赌 anaconda 刚刚在您的 PATH 变量的前面插入了它的路径，并在终端上覆盖了您较新的 3.3.2 版本。如果您希望您的 'RStudio' 版本成为在您键入 'R' 时在终端上弹出的默认版本，那么您必须修改您的 PATH。没什么大不了的。

首先，找出 RStudio 指向哪个 R 版本。在您的 RStudio 控制台中键入以下内容：

Sys.which("R")

我打赌你会看到类似 /usr/local/bin/R 的东西。所以这就是您必须添加到 PATH 前面的内容（减去“/R”）。

要确认 anaconda 把你搞砸了，打开你的终端并检查你的 PATH：

echo $PATH

您可能会看到 /Users/YOURNAME/anaconda2/bin 作为 PATH 中的第一个条目，再往下您会看到 /usr/local/bin。我们必须颠倒这个顺序。有一百万种方法可以解决这个问题。这是快速而肮脏的解决方案 - 将以下内容添加到 .bash_profile 的底部

export PATH="/usr/local/bin:$PATH"

并R --version在您的终端中输入以确认您的默认 R 已更改。

如果您的 PATH 中有两个 /usr/local/bin 条目让您烦恼（就像我一样），您稍后可能会喜欢 sed 或 awk。