有些程序不接受输入文件的进程替换吗?

And*_*imm 5 unix bash ipc process-substitution

我正在尝试将进程替换用于程序的输入文件,但它无法正常工作.是因为某些程序不允许输入文件的进程替换吗?

以下不起作用:

bash -c "cat meaningless_name"
    >sequence1
    gattacagattacagattacagattacagattacagattacagattacagattaca
    >sequence2
    gattacagattacagattacagattacagattacagattacagattacagattaca
bash -c "clustalw -align -infile=<(cat meaningless_name) -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Less verbose output, finishing with:
    No sequences in file. No alignment!
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

但以下控件确实有效:

bash -c "clustalw -align -infile=meaningless_name -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Verbose output, finishing with:
    CLUSTAL-Alignment file created  [output_alignment.aln]
bash -c "cat <(cat meaningless_name) > meaningless_name2"
diff meaningless_name meaningless_name2
    (No output: the two files are the same)
bash -c "clustalw -align -infile=meaningless_name2 -outfile=output_alignment.aln -newtree=output_tree.dnd"
    (Verbose output, finishing with:
    CLUSTAL-Alignment file created  [output_alignment.aln]
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

这表明进程替换本身有效,但clustalw程序本身不喜欢进程替换 - 可能是因为它创建了非标准文件,或者创建了具有不寻常文件名的文件.

程序不接受流程替换是否常见?我该如何检查这是否是问题?

我在Ubuntu 9.10上运行GNU bash版本4.0.33(1)-release(x86_64-pc-linux-gnu).Clustalw是版本2.0.10.

Pau*_*ce. 7

进程替换创建命名管道.你不能寻找一个命名管道.


Mat*_*hen 4

是的。我在其他程序中也注意到了同样的事情。例如,它在 emacs 中也不起作用。它给出“文件存在但无法读取”。对我来说这绝对是一个特殊的文件/proc/self/fd/some_number。在默认设置下,它在 或中都不能可靠地工作。lessmost

对于大多数:

most <(/bin/echo 'abcdef')
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

而更短的则不显示任何内容。较长的值会截断开头。 less显然有效,但前提是您指定了-f.

我发现 zsh=在实践中更有用。它在语法上是相同的,除了=代替<。但它只是创建一个临时文件,因此支持不依赖于程序。

编辑:

我发现 zsh 用于TMPPREFIX选择临时文件名。因此,即使您不希望您的 real/tmptmpfs,您也可以为 zsh 安装一个。