R：pi [[j]]中的错误：下标超出范围-数据框列表上的rbind

Question

我正在尝试rbind一个大型数据帧列表（outputDfList），该列表是通过将一个复杂的函数应用到大型表而生成的。您可以通过以下方式重新创建outputDfList：

df1=data.frame("randomseq_chr15q22.1_translocationOrInsertion", "chr15", "63126742")
names(df1)=NULL
df2=df1=data.frame("chr18q12.1_chr18q21.33_large_insertion", "chr18 ", "63126741")
names(df2)=NULL
outputDfList=list(df1,df2)

我的代码是

do.call(rbind, outputDfList)

我收到的错误消息：

Error in pi[[j]] : subscript out of bounds

我仔细检查了每个数据框的列号，它们都相同。我还尝试使用“ options（error = recover）”进行调试，但是我对它的熟悉程度不足以解决确切的问题。任何帮助表示赞赏。谢谢。

Answer 1

更新之后，看来您的问题是列名无效：数据框列名必须为非空。

更正此错误后，代码即可工作：

for (i in seq_along(outputDfList)) {
    colnames(outputDfList[[i]]) = paste0('V', seq_len(ncol(outputDfList[[i]])))
}

do.call(rbind, outputDfList)
#                                       V1     V2       V3
# 1 chr18q12.1_chr18q21.33_large_insertion chr18  63126741
# 2 chr18q12.1_chr18q21.33_large_insertion chr18  63126741

但是，我很困惑这种情况最初是如何发生的。此外，我在代码中收到的错误消息仍然与您的代码不同：

match.names（clabs，names（xi））中的错误：
名称与以前的名称不匹配