R - 整理增强置信区间

Question

我想知道如何使用broom包计算置信区间.

我想做的是简单和标准:

set.seed(1)
x <- runif(50)
y <- 2.5 + (3 * x) + rnorm(50, mean = 2.5, sd = 2)
dat <- data.frame(x = x, y = y)
mod <- lm(y ~ x, data = dat)

使用visreg我可以CI非常简单地绘制回归模型:

library(visreg)
visreg(mod, 'x',  overlay=TRUE) 

我很有兴趣使用broom和重现这个ggplot2,到目前为止我只实现了这个:

 library(broom) 

 dt = lm(y ~ x, data = dat) %>% augment(conf.int = TRUE)  
 ggplot(data = dt, aes(x, y, colour = y)) + 
  geom_point() + geom_line(data = dt, aes(x, .fitted, colour = .fitted)) 

该augment功能可按不计算conf.int.我有smooth什么线索可以增加一些信心吗？

 geom_smooth(data=dt, aes(x, y, ymin=lcl, ymax=ucl), size = 1.5, 
        colour = "red", se = TRUE, stat = "smooth")

Answer 1

使用broom输出,您可以执行以下操作:

ggplot(data = dt, aes(x, y)) + 
  geom_ribbon(aes(ymin=.fitted-1.96*.se.fit, ymax=.fitted+1.96*.se.fit), alpha=0.2) +
  geom_point(aes(colour = y)) + 
  geom_line(aes(x, .fitted, colour = .fitted)) +
  theme_bw()

我搬进colour=y来geom_point()是因为你无法应用色彩美学geom_ribbon.