我想cytoscape.js用于可视化图形。虽然我能够用语言（无数C++，Mathematica，R，等），我是新来的Javascript，JSON，HTML，和CSS。因此，通过此用例（使用来实现图cytoscape.js）来学习这些语言将是有利的。请记住这一点。
我以前曾问过[如何远程加载cytoscape.js以及如何显示图形（要求a div）。从那时起，我创建了一个脚本，该脚本可以将以我使用的其他一种语言表示的图形转换为此处JSON所示的格式。虽然我可以将所有这些内容直接直接复制粘贴到我的程序中，但是对于大型网络而言，显然这是实现它的一种较差的方法。我的脚本输出的一个示例在此底部。
给定一个JSON对象/文件（？），我该如何做以下工作：
cytoscape.js无需复制粘贴代码即可将其加载到。cytoscape.js）cytoscape({
container: document.getElementById('cy'),
elements: [
{// node Node 1
group: 'nodes',
data: {
id: 'Node 1'
},
selected: false,
selectable: true,
locked: false,
grabbable: true,
selectable: true,
},
{// node Node 2
group: 'nodes',
data: {
id: 'Node 2'
},
selected: false,
selectable: true,
locked: false,
grabbable: true,
selectable: true,
},
{// node Node 3
group: 'nodes',
data: {
id: 'Node 3'
},
selected: false,
selectable: true,
locked: false,
grabbable: true,
selectable: true,
},
{// edge 1_2
group: 'edges',
data: {
id: '1_2',
source: '1',
target: '2'
}
},
{// edge 2_3
group: 'edges',
data: {
id: '2_3',
source: '2',
target: '3'
}
},
{// edge 3_1
group: 'edges',
data: {
id: '3_1',
source: '3',
target: '1'
}
}
],
style: [
{
selector: 'node',
style: {
'content': 'data(id)'
}
}
]
});
小智 6
<head>
<title></title>
<script src="js/vendor/cytoscape.min.js"></script>
<script src="js/vendor/jquery.min.js"></script>
</head>
<style>
#cy {
width: 100%;
height: 100%;
position: absolute;
top: 0px;
left: 0px;
}
</style>
<body>
<div id="cy"></div>
<script>
$.getJSON("cyto.js", function (data) {
//console.log(data);
var cy = cytoscape({
container: document.getElementById('cy'),
elements: data,
style: [
{
selector: 'node',
style: {
'label': 'data(label)',
'width': '60px',
'height': '60px',
'color': 'blue',
'background-fit': 'contain',
'background-clip': 'none'
}
}, {
selector: 'edge',
style: {
'text-background-color': 'yellow',
'text-background-opacity': 0.4,
'width': '6px',
'target-arrow-shape': 'triangle',
'control-point-step-size': '140px'
}
}
],
layout: {
name: 'circle'
}
});
});
</script>
</body>
在cyto.js中，您可以输入有效的JSON数据，例如
{
"nodes": [
{
"data": {"id": "a", "label": "Gene1"}
},
{
"data": {"id": "b", "label": "Gene2"}
},
{
"data": {"id": "c", "label": "Gene3"}
},
{
"data": {"id": "d", "label": "Gene4"}
},
{
"data": {"id": "e", "label": "Gene5"}
},
{
"data": {"id": "f", "label": "Gene6"}
}
],
"edges": [
{
"data": {
"id": "ab",
"source": "a",
"target": "b"
}
},
{
"data": {
"id": "cd",
"source": "c",
"target": "d"
}
},
{
"data": {
"id": "ef",
"source": "e",
"target": "f"
}
},
{
"data": {
"id": "ac",
"source": "a",
"target": "d"
}
},
{
"data": {
"id": "be",
"source": "b",
"target": "e"
}
}]
}
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