Jos*_*ant 3 r ggplot2 ggfortify
我希望能够调整加载标签的位置,以便它们不会落在箭头上方。但不知道哪里需要调整。可以geom_text用来调整站点位置的位置,但我找不到向量存储在的位置str(g)。
library(ggplot2)
library(ggfortify)
df <- data.frame(replicate(10,sample(-10:10,10,rep=TRUE)))
names(df) <- c('up','down','left','right','circle','square','triangle','x','r1','l1')
rownames(df) <- paste('Dummy Site', seq(0,9,1))
g <- autoplot(prcomp(df[,-11], scale=TRUE), data=df,
loadings.label=TRUE, loadings=TRUE,
loadings.label.size=8, loadings.colour='blue',
label.size=5) +
geom_text(vjust=-1, label=rownames(df)) +
theme(plot.background=element_blank(),
panel.background=element_rect(fill='transparent',color='black',size=1),
legend.text=element_text(hjust=1),
legend.key=element_blank())
g
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我已经查看ggplot2::theme并检查了 的帮助文档autoplot,但找不到任何关于调整标签位置的提及。如果它可以根据箭头的矢量进行调整,则会加分,但静态调整也是可以接受的。
可以通过 获取坐标layer_data(g, 2)。但autoplot(prcomp.obj)将其他参数传递给ggbiplot(),因此您可以使用 的参数进行更改label和定位,例如(请参阅)。loadings.labelggbiplot()loadings.label.hjust?ggbiplot
arrow_ends <- layer_data(g, 2)[,c(2,4)]
autoplot(prcomp(df[,-11], scale=TRUE), data=df,
loadings.label=TRUE, loadings=TRUE,
loadings.label.size=8, loadings.colour='blue',
label.size=5, loadings.label.vjust = 1.2) + # change loadings.label position
geom_point(data = arrow_ends, aes(xend, yend), size = 3) + # the coordinates from layer_data(...)
geom_text(vjust=-1, label=rownames(df)) +
theme(plot.background=element_blank(),
panel.background=element_rect(fill='transparent',color='black',size=1),
legend.text=element_text(hjust=1),
legend.key=element_blank())
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