如何将 HL7 v2.x 消息转换为 FHIR JSON？

Question

我正在尝试使用 java 或 python 将 HL7 v2.x 消息转换为 FHIR JSON。但我找不到任何解决方案。有没有办法实现这一目标？

我发现 FHIR 能够转换为 JSON，但我不知道该怎么做。

Answer 1

这是一个建议：

1. 下载并安装 Mirth Connect
2. 创建一个新频道
3. 在“脚本”选项卡下，选择“预处理器”
4. 使用以下命令将 HL7 消息转换为 XML：

// Modify the message variable below to pre process data
message = SerializerFactory.getSerializer('HL7V2').toXML(message);
    
return message;

5. 现在您在变量message 中有了 XML 文件，因此您可以编写内联代码将其转换为 JSON，而无需从这里获取库：https : //davidwalsh.name/convert-xml-json

Answer 2

关于 HL7 2.x

HL7 2.x 版本既不支持 XML 也不支持 JSON作为标准的一部分。

HL7 2.5 版及更早版本的第 2 版 v2.xml XML 模式由 Sun Microsystems 提供。提供这些表示是为了方便，因为 XML 模式是一种描述 XML 表示的紧凑且特定的方式。然而，模式本身并不是本规范的规范部分。
_hl7.org

正如您在上面看到的，“v2.xml XML Schemas”不是规范的一部分。它们是额外的贡献。

本规范的目标是为基于可扩展标记语言 XML 的 HL7 版本 2.3.1、2.4、2.5 和未来的 2.x 消息提供编码规则，可在发送方和接收方都理解 XML 的环境中使用。所述v2.xml说明书旨在充当第二规范编码为V2.3.1，2.4版和V2.5（HL7的版本2.x标准的和将来的版本）。
_hl7.org

以下是维基百科的引述：

HL7 v2.x 消息使用基于段（行）和单字符分隔符_维基百科的非 XML 编码语法

关于 HL7 v3.x

HL7 v3.x 版本支持将 XML 作为标准的一部分。

几种 XML 编码方法可以用作 HL7 V3 消息的消息传递语法。本文档代表了 HL7 推荐的方法，描述了基本规则和原则。本规范所需的相应数据类型描述在数据类型 XML ITS 中进行了描述。
_hl7.org

以下引用自《HL7 V3 指南》：

HL7 在抽象级别定义其消息。HL7 中的“7”代表 ISO 通信模型的应用级别——ISO 级别 7。该级别强调消息的语义内容，而不是它们的表示方式，也不是这些表示如何编码以进行传输。

HL7 在抽象级别定义其消息。HL7 中的“7”代表 ISO 通信模型的应用级别——ISO 级别 7。该级别强调消息的语义内容，而不是它们的表示方式，也不是这些表示如何编码以进行传输。

HL7 版本 2 抽象消息模型具有段和字段的概念。它定义了一种特殊的编码方案来表示抽象消息的实例——所谓的“垂直条编码”。来自 Health 域（语义级别 7）的信息在版本 2 中表示为段和字段，并表示为带有大量竖线的 ASCII 字符。与这种方法一致，V2 的新 XML 编码大多是对竖线编码的直接替代

第 3 版抽象消息模型基于 RIM。HL7 版本 3 消息可以被认为是从发送方到接收方的 RIM 对象图的通信。ITS 可以通过对对象、属性和数据类型进行适当的表示来最好地处理这些消息的表示。
_{hl7.ihelse.net}

以下是维基百科的引述：

HL7 v3 消息基于 XML 编码语
_{法维基百科}

您可以在此处阅读有关兼容性的更多信息。

它们都不支持 JSON 作为标准的一部分。
因此，从 HL7 到 XML 或 HL7 到 JSON 的转换是不合标准的；一个需要自己处理。

关于 FHIR（快速医疗互操作性资源）

FHIR 是由 HL7 发布的医疗保健数据交换标准。
在此处查看 HL7 和 FHIR 之间的关系。

所述FHIR同时支持XML和JSON格式为标准的一部分。请参阅这些链接了解更多详情。

将 v2 转换为 FHIR：

总的来说，这种转换有两种方法：

• 创建反映 v2 消息内容的 FHIR 消息包，旨在作为等效表示，其行为方式与 v2 消息相同
• 使用 v2 消息的内容来更新 FHIR 服务器 - 可能是提取 Encounter 资源或创建一个 Bundle，该 Bundle 旨在充当针对 FHIR 服务器的“交易”包。我认为这将是一个更常见的用例。

_FHIR博客

请阅读该博客以了解有关转换的详细信息。社区正在致力于转换；希望开箱即用的解决方案很快可用。

v2 和 FHIR 之间的转换是社区正在做的事情——这里有一个聊天流：https : //chat.fhir.org/#narrow/stream/179188-v2-to.20FHIR，你可以在那里参与进来。两个标准之间的映射需要一些工作来定义，并且在实现上会有差异，但该项目的目标是定义一个“基础”映射作为起点。v2 和 FHIR 之间的关系相当密切，但还有很多问题需要解决……

没有单一的方法可以实际执行转换 - 这将取决于您必须掌握的技术。例如，在这篇文章中，我在 NodeRED 中使用了简单的 javascript——尽管只是作为概念证明。我想大多数集成引擎供应商都会在这个领域提供产品。
_评论

HL7 站点上解释了映射详细信息。

以下是一些工具：

https://github.com/rimiti/hl7-object-parser#hl7-object-parser（HL7 v2.x 到 JSON）
https://github.com/nezt/hl72xml#hl72xml（HL7 V2.x 到 XML）
https://github.com/KevinMayfield/ITKHL7v2-FHIR

Mirth 提供了将 HL7 转换为 XML/JSON 的功能。
请参阅@Bryan 的其他答案。
很少有样本可以在这里和这里找到。