根据条件创建新的numpy数组

use*_*827 2 python performance numpy vectorization

我有2个numpy数组:

aa = np.random.rand(5,5)
bb = np.random.rand(5,5)
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当aa和bb都超过0.5时,如何创建一个值为1的新数组?

Div*_*kar 8

关注性能并使用两种方法可以添加很少的方法.一种方法是获取有效的布尔数组并转换为int数据类型.astype() method.另一种方法可能涉及使用np.where,让我们之间进行选择0,并1在同一布尔数组基于.因此,基本上我们有两种方法,一种利用有效的数据类型转换,另一种利用选择标准.现在,布尔数组可以通过两种方式获得 - 一种使用简单比较,另一种使用np.logical_and.因此,有两种获取布尔数组的方法和两种将布尔数组转换为int数组的方法,我们最终会得到四种实现,如下所示 -

out1 = ((aa>0.5) & (bb>0.5)).astype(int)
out2 = np.logical_and(aa>0.5, bb>0.5).astype(int)
out3 = np.where((aa>0.5) & (bb>0.5),1,0)
out4 = np.where(np.logical_and(aa>0.5, bb>0.5), 1, 0)
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您可以使用数据类型来使用较少的精度类型,这应该不会因为我们设置值01无论如何都会受到影响.这种优势应该是明显的加速,因为它利用了内存效率.我们可以使用int8,uint8,np.int8,np.uint8类型.因此,使用新int数据类型的早期列出的方法的变体将是 -

out5 = ((aa>0.5) & (bb>0.5)).astype('int8')
out6 = np.logical_and(aa>0.5, bb>0.5).astype('int8')
out7 = ((aa>0.5) & (bb>0.5)).astype('uint8')
out8 = np.logical_and(aa>0.5, bb>0.5).astype('uint8')

out9 = ((aa>0.5) & (bb>0.5)).astype(np.int8)
out10 = np.logical_and(aa>0.5, bb>0.5).astype(np.int8)
out11 = ((aa>0.5) & (bb>0.5)).astype(np.uint8)
out12 = np.logical_and(aa>0.5, bb>0.5).astype(np.uint8)
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运行时测试(因为我们专注于这篇文章的表现) -

In [17]: # Input arrays
    ...: aa = np.random.rand(1000,1000)
    ...: bb = np.random.rand(1000,1000)
    ...: 

In [18]: %timeit ((aa>0.5) & (bb>0.5)).astype(int)
    ...: %timeit np.logical_and(aa>0.5, bb>0.5).astype(int)
    ...: %timeit np.where((aa>0.5) & (bb>0.5),1,0)
    ...: %timeit np.where(np.logical_and(aa>0.5, bb>0.5), 1, 0)
    ...: 
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In [19]: %timeit ((aa>0.5) & (bb>0.5)).astype('int8')
    ...: %timeit np.logical_and(aa>0.5, bb>0.5).astype('int8')
    ...: %timeit ((aa>0.5) & (bb>0.5)).astype('uint8')
    ...: %timeit np.logical_and(aa>0.5, bb>0.5).astype('uint8')
    ...: 
    ...: %timeit ((aa>0.5) & (bb>0.5)).astype(np.int8)
    ...: %timeit np.logical_and(aa>0.5, bb>0.5).astype(np.int8)
    ...: %timeit ((aa>0.5) & (bb>0.5)).astype(np.uint8)
    ...: %timeit np.logical_and(aa>0.5, bb>0.5).astype(np.uint8)
    ...: 
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In [20]: %timeit 1 * ((aa > 0.5) & (bb > 0.5)) #@BPL's vectorized soln
100 loops, best of 3: 10.2 ms per loop
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