更改 numpy 结构化数组数据类型名称和格式

And*_*rew 5 python numpy python-3.x structured-array

我正在用 numpy 中的结构化数组做一些工作(我最终将转换为 Pandas 数据帧)。

现在,我通过读取一些数据(实际上是对一些数据进行内存映射)然后通过用户指定的约束对其进行过滤来生成这个结构化数组。然后,我想将这些数据从我读入的形式(所有内容都是 int 以节省我从中读取的文件中的空间)转换为更有用的格式,以便我可以进行一些单位转换(即向上转换为一个浮点数)。

在改变结构化数据类型的过程中,我注意到了一个有趣的工件(或其他东西)。假设读取数据会产生与以下创建的相同的结构化数组(请注意,在实际代码中,dtype 更长且更复杂,但这对于 mwe 来说就足够了):

import numpy as np

names = ['foo', 'bar']
formats = ['i4', 'i4']

dtype = np.dtype({'names': names, 'formats': formats})

data = np.array([(1, 2), (3, 4)], dtype=dtype)
print(data)
print(data.dtype)
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这造成

[(1, 2) (3, 4)]
[('foo', '<i4'), ('bar', '<i4')]
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作为结构化数组

现在,假设我想将这两个 dtype 上转换为 double,同时重命名第二个组件。这似乎应该很容易

names[1] = 'baz'

formats[0] = np.float
formats[1] = np.float

dtype_new = np.dtype({'names': names, 'formats': formats})

data2 = data.copy().astype(dtype_new)

print(data2)
print(data2.dtype)
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但结果出乎意料

(1.0, 0.0) (3.0, 0.0)]
[('foo', '<f8'), ('baz', '<f8')]
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来自第二个组件的数据发生了什么变化?我们可以做这个转换但是如果我们把事情分开

dtype_new3 = np.dtype({'names': names, 'formats': formats})

data3 = data.copy().astype(dtype_new3)

print(data3)
print(data3.dtype)

names[1] = 'baz'
data4 = data3.copy()
data4.dtype.names = names

print(data4)
print(data4.dtype)
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这导致正确的输出

[(1.0, 2.0) (3.0, 4.0)]
[('foo', '<f8'), ('bar', '<f8')]
[(1.0, 2.0) (3.0, 4.0)]
[('foo', '<f8'), ('baz', '<f8')]
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看起来,当astype使用结构化的 dtype 调用时,numpy 匹配每个组件的名称,然后将指定的类型应用于内容(这里只是猜测,没有看源代码)。有没有办法一次完成这个转换(即格式的名称和上转换),或者它是否只需要完成它的步骤。(如果需要分步完成,这不是什么大不了的事,但对我来说,没有一步法可以做到这一点似乎很奇怪。)

hpa*_*ulj 5

有一个设计用于处理recarray(以及结构化数组)的函数库。它有点隐藏,所以我必须搜索才能找到它。它具有重命名字段、添加和删除字段等功能。一般的操作模式是使用目标 dtype 创建一个新数组,然后逐个复制字段。由于数组通常有许多元素和少量字段,因此这不会减慢速度。

看起来这种astype方法正在使用其中的一些代码,或者可能以相同方式运行的编译代码。

所以是的,看起来我们确实需要在单独的步骤中更改字段 dtypes 和名称。

In [1279]: data=np.array([(1,2),(3,4)],dtype='i,i')
In [1280]: data
Out[1280]: 
array([(1, 2), (3, 4)], 
      dtype=[('f0', '<i4'), ('f1', '<i4')])
In [1281]: dataf=data.astype('f8,f8')     # change dtype, same default names
In [1282]: dataf
Out[1282]: 
array([(1.0, 2.0), (3.0, 4.0)], 
      dtype=[('f0', '<f8'), ('f1', '<f8')])
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轻松改名:

In [1284]: dataf.dtype.names=['one','two'] 
In [1285]: dataf
Out[1285]: 
array([(1.0, 2.0), (3.0, 4.0)], 
      dtype=[('one', '<f8'), ('two', '<f8')])

In [1286]: data.astype(dataf.dtype)
Out[1286]: 
array([(0.0, 0.0), (0.0, 0.0)], 
      dtype=[('one', '<f8'), ('two', '<f8')])
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astype与名称不匹配产生一个zero阵列,相同的np.zeros(data.shape,dataf.dtype)。通过匹配名称,而不是在 dtype 中的位置,我可以重新排序值,甚至添加字段。

In [1291]: data.astype([('f1','f8'),('f0','f'),('f3','i')])
Out[1291]: 
array([(2.0, 1.0, 0), (4.0, 3.0, 0)], 
      dtype=[('f1', '<f8'), ('f0', '<f4'), ('f3', '<i4')])
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