困惑重新:pandas数据帧警告片的副本

Sam*_*eld 17 python pandas chained-assignment

我已经查看了一堆与此问题相关的问题和答案,但我仍然发现我在我不期望的地方得到了这个切片警告的副本.此外,它在我之前运行良好的代码中出现,让我想知道某种更新是否可能是罪魁祸首.

例如,这是一组代码,我所做的就是将Excel文件读入一个pandas DataFrame,并减少df[[]]语法中包含的列集.

 izmir = pd.read_excel(filepath)
 izmir_lim = izmir[['Gender','Age','MC_OLD_M>=60','MC_OLD_F>=60','MC_OLD_M>18','MC_OLD_F>18','MC_OLD_18>M>5','MC_OLD_18>F>5',
               'MC_OLD_M_Child<5','MC_OLD_F_Child<5','MC_OLD_M>0<=1','MC_OLD_F>0<=1','Date to Delivery','Date to insert','Date of Entery']]
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现在,我对此izmir_lim文件所做的任何进一步更改都会引发切片警告的副本.

izmir_lim['Age'] = izmir_lim.Age.fillna(0)
izmir_lim['Age'] = izmir_lim.Age.astype(int)
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/Users/samlilienfeld/anaconda/lib/python3.5/site-packages/ipykernel/ main .py:2:SettingWithCopyWarning:尝试在DataFrame的切片副本上设置值.尝试使用.loc [row_indexer,col_indexer] = value

我很困惑因为我认为df[[]]列子集默认返回了一个副本.我发现抑制错误的唯一方法是明确添加df[[]].copy().我本来可以发誓,过去我没有那么做,也没有提出切片错误的副本.

同样,我有一些其他代码在数据帧上运行一个函数,以某种方式过滤它:

def lim(df):
if (geography == "All"):
    df_geo = df
else:
    df_geo = df[df.center_JO == geography]

df_date = df_geo[(df_geo.date_survey >= start_date) & (df_geo.date_survey <= end_date)]

return df_date

df_lim = lim(df)
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从这一点开始,我对任何值进行的任何更改都会df_lim引发切片错误的副本.我找到的唯一方法是将函数调用更改为:

df_lim = lim(df).copy()
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这对我来说似乎不对.我错过了什么?看起来这些用例应该默认返回副本,我可以发誓上次运行这些脚本时我没有遇到这些错误.
我只需要开始添加.copy()到处吗?似乎应该有一个更清洁的方法来做到这一点.任何见解或帮助都非常感谢.

piR*_*red 17

 izmir = pd.read_excel(filepath)
 izmir_lim = izmir[['Gender','Age','MC_OLD_M>=60','MC_OLD_F>=60',
                    'MC_OLD_M>18','MC_OLD_F>18','MC_OLD_18>M>5',
                    'MC_OLD_18>F>5','MC_OLD_M_Child<5','MC_OLD_F_Child<5',
                    'MC_OLD_M>0<=1','MC_OLD_F>0<=1','Date to Delivery',
                    'Date to insert','Date of Entery']]
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izmir_lim是一个视图/副本izmir.您随后尝试分配给它.这就是抛出错误的原因.请改用:

 izmir_lim = izmir[['Gender','Age','MC_OLD_M>=60','MC_OLD_F>=60',
                    'MC_OLD_M>18','MC_OLD_F>18','MC_OLD_18>M>5',
                    'MC_OLD_18>F>5','MC_OLD_M_Child<5','MC_OLD_F_Child<5',
                    'MC_OLD_M>0<=1','MC_OLD_F>0<=1','Date to Delivery',
                    'Date to insert','Date of Entery']].copy()
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每当您以下列方式从另一个创建新数据框时:

new_df = old_df[list_of_columns_names]
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new_df将在其is_copy属性中具有真实价值.当你尝试分配它时,pandas会抛出SettingWithCopyWarning.

new_df.iloc[0, 0] = 1  # Should throw an error
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你可以通过几种方式克服这个问题.

选项1

new_df = old_df[list_of_columns_names].copy()
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选项#2(正如@hanhan在评论中建议的那样)

new_df = old_df[list_of_columns_names]
new_df.is_copy = None
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选项#3

new_df = old_df.loc[:, list_of_columns_names]
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  • 即使使用`.loc`索引数据帧,我仍然继续以令人困惑的方式遇到这个错误。例如,我正在创建一个过滤数据框,它删除具有空值的行,如下所示:`df_no_none = df_trans.loc[df_trans.value.notnull()]`。每当我操作“df_no_none”时,我都会继续获取切片错误的副本。有任何想法吗? (3认同)
  • 选项 #1 (`df[cols].copy()`) 和 #3 (`df.loc[:, cols]`) 可能都可以工作**但它们做不同的事情。**虽然前者制作副本,后者提供原始数据帧的直接切片。因此,使用#3 更改值也会更改原始数据帧,而使用#1 则不会。 (2认同)