如何解决R Markdown（Knit）“'closure'不能被子集化”？

Question

我正在尝试第一次使用RMarkdown（Knit）生成pdf。默认文件（“文件”>“新文件”>“ R Markdown”）运行良好，编译后会显示生成的pdf。例如，以下代码运行，

```{r cars}
summary(cars)
```

但是，如果我只是用“ myData”换车，它不会编译并显示，

Error in object[[i]] : object of type 'closure' is not subsettable
Calls: <Anonymous> ... withVisible -> eval -> eval -> summary -> summary.default
Execution halted

我在全局环境中加载了“ myData”，并且可以在原始R脚本中执行其他操作。有人可以提供一些指南吗？非常感谢您的宝贵时间。

Answer 1

运行Rmarkdown文件将启动一个新的R会话。

在新会话中，您可以加载存储在data包中的data.frames ，但是必须从Rmarkdown文档中加载其他数据集。

为了使myData显示在Rmarkdown文档中，

1. 将文件保存save在当前R会话中的某个位置
2. 然后在您的Rmarkdown文档中，使用load来打开数据集

因此，在您当前的R会话中：

save(myData, file="<path>/myData.Rdata")

并在您的Rmarkdown文件中：

```{r myDataSummary}
load("<path>/myData.Rdata")
summary(myData)
```

如果您的数据存储为文本文件，并且您不想存储单独的.R文件，请read.csv在Rmarkdown文件中直接使用或朋友。

```{r myDataSummary}
myData <- read.csv("<path>/myCSV.csv")
summary(myData)
```