d_1*_*999 5 fortran transpose memory-layout multidimensional-array reshape
我正在尝试在 Fortran 中编写一些代码,这需要重新排序 n 维数组。我认为重塑内在与order参数应该允许这样做,但是我遇到了困难。
考虑以下最小示例
program test
implicit none
real, dimension(:,:,:,:,:), allocatable :: matA, matB
integer, parameter :: n1=3, n2=5, n3=7, n4=11, n5=13
integer :: i1, i2, i3, i4, i5
allocate(matA(n1,n2,n3,n4,n5)) !Source array
allocate(matB(n3,n2,n4,n1,n5)) !Reshaped array
!Populate matA
do i5=1, n5
do i4=1, n4
do i3=1, n3
do i2=1, n2
do i1=1, n1
matA(i1,i2,i3,i4,i5) = i1+i2*10+i3*100+i4*10000+i5*1000000
enddo
enddo
enddo
enddo
enddo
print*,"Ad1 : ",matA(:,1,1,1,1),shape(matA)
matB = reshape(matA, shape(matB), order = [3,2,4,1,5])
print*,"Bd4 : ",matB(1,1,1,:,1),shape(matB) !Leading dimension of A is the fourth dimension of B
end program test
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我希望这会导致
Ad1 : 1010111.00 1010112.00 1010113.00 3 5 7 11 13
Bd4 : 1010111.00 1010112.00 1010113.00 7 5 11 3 13
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但相反,我发现:
Ad1 : 1010111.00 1010112.00 1010113.00 3 5 7 11 13
Bd4 : 1010111.00 1010442.00 1020123.00 7 5 11 3 13
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我已经用gfortran(4.8.3 和 4.9) 和ifort(11.0)尝试过这个并找到了相同的结果,所以很可能我只是误解了关于重塑如何工作的一些东西。
任何人都可以阐明我哪里出错了以及我如何实现我的目标?
因为我也觉得多维数组的行为order非常不直观,所以我在下面做了一些代码比较,以使情况更加清晰(除了已经完整的@francescalus'答案)。首先,在一个简单的情况下,reshape()with 和 withoutorder给出以下内容:
mat = reshape( [1,2,3,4,5,6,7,8], [2,4] )
=> [ 1 3 5 7 ;
2 4 6 8 ]
mat = reshape( [1,2,3,4,5,6,7,8], [2,4], order=[2,1] )
=> [ 1 2 3 4 ;
5 6 7 8 ]
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此示例显示,如果没有,order元素将以通常的列优先方式填充,而如果使用order=[2,1]第二维,则运行速度更快,因此元素会按行填充。这里的关键点是order指定 LHS(而不是源数组)的哪个维度运行得更快(如上面答案中所强调的)。
现在我们将相同的机制应用于更高维度的情况。首先,reshape()5维数组没有order
matB = reshape( matA, [n3,n2,n4,n1,n5] )
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对应于显式循环
k = 0
do i5 = 1, n5 !! (5)-th dimension of LHS
do i1 = 1, n1 !! (4)
do i4 = 1, n4 !! (3)
do i2 = 1, n2 !! (2)
do i3 = 1, n3 !! (1)-st dimension of LHS
k = k + 1
matB( i3, i2, i4, i1, i5 ) = matA_seq( k )
enddo;enddo;enddo;enddo;enddo
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其中matA_seq是 的顺序视图matA
real, pointer :: matA_seq(:)
matA_seq( 1 : n1*n2*n3*n4*n5 ) => matA(:,:,:,:,:)
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现在附加order=[3,2,4,1,5]到reshape(),
matB = reshape( matA, [n3,n2,n4,n1,n5], order = [3,2,4,1,5] )
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然后改变 DO 循环的顺序,使得
k = 0
do i5 = 1, n5 !! (5)-th dim of LHS
do i3 = 1, n3 !! (1)
do i1 = 1, n1 !! (4)
do i2 = 1, n2 !! (2)
do i4 = 1, n4 !! (3)-rd dim of LHS
k = k + 1
matB( i3, i2, i4, i1, i5 ) = matA_seq( k )
enddo;enddo;enddo;enddo;enddo
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这意味着matB(因此i4) 的第三个维度运行最快(对应于上面答案中的第二行)。但OP想要的是
k = 0
do i5 = 1, n5 !! (5)-th dim of LHS
do i4 = 1, n4 !! (3)
do i3 = 1, n3 !! (1)
do i2 = 1, n2 !! (2)
do i1 = 1, n1 !! (4)-th dim of LHS
k = k + 1
matB( i3, i2, i4, i1, i5 ) = matA_seq( k )
enddo;enddo;enddo;enddo;enddo
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这对应于
matB = reshape( matA, [n3,n2,n4,n1,n5], order = [4,2,1,3,5] )
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即,francescalus 答案的最后一行。
希望这次比较能进一步澄清情况......
当order=被指定时reshape,以置换下标顺序获取的结果的元素对应于源数组的元素。这可能还不完全清楚。Fortran 2008 标准将其表述为(忽略有关 的部分pad=)
结果的元素采用排列下标顺序 ORDER (1), ..., ORDER (n),是 SOURCE 的正常数组元素顺序 ..
这意味着从您的示例中order=[3,2,4,1,5]可以映射到
matA(1,1,1,1,1), matA(2,1,1,1,1), matA(3,1,1,1,1), matA(1,2,1,1,1), ...
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的
matB(1,1,1,1,1), matB(1,1,2,1,1), matB(1,1,3,1,1), matB(1,1,4,1,1), ...
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偏移量在 的第三个索引中变化最快,matB对应于 的第一个索引中变化最快matA。下一个变化最快的matB是 2 维,然后是 4 维,依此类推。
matB(1,1,1:3,1,1)所以,它是对应于 的元素matA(:,1,1,1,1)。
我已经明确说明了该切片的范围,matB因为您对 的形状有疑问matB:您希望 的形状matB是说明order=符给出的排列的逆。
你可以把你的例子写成
implicit none
integer, parameter :: n1=3, n2=5, n3=7, n4=11, n5=13
integer matA(n1,n2,n3,n4,n5)
integer matB(n4,n2,n1,n3,n5) ! Inverse of permutation (3 2 4 1 5)
integer i1, i2, i3, i4, i5
forall (i1=1:n1, i2=1:n2, i3=1:n3, i4=1:n4, i5=1:n5) &
matA(i1,i2,i3,i4,i5)=i1+i2*10+i3*100+i4*10000+i5*1000000
print*,"Ad1 : ",matA(:,1,1,1,1),shape(matA)
matB = reshape(matA, shape(matB), order = [3,2,4,1,5])
print*,"Bd3 : ",matB(1,1,:,1,1),shape(matB)
end
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或者,如果它是您想要的形状matB,那么它就是需要反转的顺序排列:
matB = reshape(matA, shape(matB), order = [4,2,1,3,5])
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乍一看,可能很自然地会看到与源尺寸相关的顺序。然而,以下内容可能会澄清:无论源的形状如何,重塑的结果都是相同的(使用的是按自然顺序排列的数组元素);该order=值的大小等于该shape=值的大小。对于第一个,如果源是[1,2,3,4,5,6](回想一下我们如何构造 2 级数组),那么如果在源上使用它,则order=永远不会产生任何效果(它必须是)。[1]