将Conda环境与Jupyter Notebook联系起来

Question

我正在努力为python做一些科学的东西设置一个良好的环境.为此,我安装了Jupyter和miniconda.

然后我希望能够拥有不同的环境,并将它们与Jupyter笔记本一起使用.所以我用conda创建了两个自定义env:py27和py35.

> conda env list
# conda environments:
#
py27                     /Users/***/miniconda3/envs/py27
py35                     /Users/***/miniconda3/envs/py35
root                  *  /Users/***/miniconda3

然后在我的笔记本上我有两个内核python 2和python 3.在笔记本内部,我使用python3内核获得以下内容:

> import sys
> print(sys.executable)
/Users/***/miniconda3/envs/py35/bin/python

这与python2内核:

> import sys
> print(sys.executable)
/usr/local/opt/python/bin/python2.7

• 如何设置sys.executable为python2的miniconda env？
• 如何将conda env与笔记本内核绑定？
• 正在做source activate py35一个链接jupyter notebook吗？

我想我真的错过了什么.

谢谢大家.

---编辑

我有多个jupyter bin:

> where jupyter
/usr/local/bin/jupyter
/usr/local/bin/jupyter
/Users/ThomasDehaeze/miniconda3/bin/jupyter

我这里只有一个内核/usr/local/share/jupyter/kernels/python2.但在Jupyter里面,我有两个内核,python2而且python3.我在哪里可以找到另一个？

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我修改kernel.json自/usr/local/share/jupyter/kernels/python2:

{
 "display_name": "Python 2",
 "language": "python",
 "argv": [
  "/Users/***/miniconda3/envs/py27/bin/python2.7",
  "-m",
  "ipykernel",
  "-f",
  "{connection_file}"
 ]
}

然后 :

import sys
print(sys.executable)
/usr/local/opt/python/bin/python2.7

所以没有任何改变

Answer 1

对于Anaconda,我建议你一个更容易和更合适的解决方案; 只需看一下nb_conda_kernels包.

它允许您"在Jupyter Notebook中管理基于conda环境的内核".

自Anaconda版本4.1.0以来应该包括在内,否则只需使用

conda install nb_conda

现在,您应该能够从Notebook界面直接管理所有目标.

Answer 2

假设您的conda-env被命名为cenv，它很简单：

    $ conda activate cenv
    (cenv)$ conda install ipykernel
    (cenv)$ ipython kernel install --user --name=<any_name_for_kernel>
    (cenv($ conda deactivate

如果重新启动jupyter笔记本/实验室，您将能够看到可用的新内核。

PS：如果您正在使用virtualenv等，上述步骤将很有效。

Answer 3

我找到了解决方案.内核的设置位于此处~/Library/Jupyter/kernels/.

然后我修改了kernel.json文件并设置了正确的python路径.

现在它正在运作.

Answer 4

不知道还有什么帮助，但是对我来说至关重要的是安装nb_conda_kernels在root conda环境中。尝试将其安装在特定的conda环境中并没有最终使Jupyter Notebook能够使用默认环境以外的其他conda环境。

conda install -n root nb_conda_kernels

jupyter notebook