Cox回归Python

Question

请帮助python中是否有用于Cox回归的软件包？还是我们可以制作Rpy？我知道这个例子，但它是R

https://plot.ly/ipython-notebooks/survival-analysis-r-vs-python/#Loading-data-into-python-and-R

Answer 1

我只想提供截至 2020 年 7 月的更新答案：

• 正如ilse提到的，生命线是所有生存分析的一个很好的包。它配合得很好pandas，并且有一些很棒的开箱即用的可视化工具。它正在不断开发和更新。此外，它的文档非常详尽。我什至建议阅读它作为研究一般生存分析的起点。
• scikit-surv是另一种选择。虽然它缺乏生命线的一些功能，但它的强项是它基于scikit-learn，这使得与管道中的其他构建块结合起来非常容易。此外，它还包括用于生存的 ML 算法的实现，例如随机生存森林和SSVM。
• 最后，我们有PySurvival。我对这个框架没有经验，但看起来它也有很多算法。它是建立在PyTorch等之上的。

Answer 2

Python中的lifelines软件包提供了生存分析，包括Cox比例风险拟合器：https : //lifelines.readthedocs.io/en/latest/