使用 mongolite R 包将 json 对象插入到 MongoDB 中

Question

在 R 中有很多用于处理 MongoDB 的包。我开始使用 'mongolite' 包，因为我使用 'jsonlite' 和 'mongolite' 构建在 'jsonlite' 之上。但是，我有点困惑，为什么“mongolite”中的插入函数不允许插入 json 对象（帮助说它插入数据帧）？

我应该使用什么包来存储 json 对象并进行简单的查询？

Answer 1

如果您使用，jsonlite您仍然可以使用mongolite来插入您的数据，但前提是它也可以被强制转换为data.frame（使用fromJSON）。例如：

js <- '[
  {
    "id": 1,
    "val": "a"
  },
  {
    "id": 2,
    "val": "b"
  },
  {
    "id": 3,
    "val": "c"
  }
] '


library(jsonlite)
library(mongolite)

mongo <- mongo(collection = "test", db = "test", url = "mongodb://localhost",
      verbose = TRUE)

mongo$insert(fromJSON(js))
# Complete! Processed total of 3 rows.
# [1] TRUE

但是，我的理解是该mongolite包只会插入data.frames. 例如，采用更复杂的JSON结构，您将看到我们无法使用mongolite

js <- '{"foo":[{"id":1,"val":"a"},{"id":2,"val":"b"},{"id":3,"val":"c"}],"bar":[[{"id":1,"val":"a"},{"id":2,"val":"b"},{"id":3,"val":"c"}]]}'

## if we try to insert this using mongolite we get an error
## because it is not a data.frame
> mongo$insert(fromJSON(js))
Error: is.data.frame(data) is not TRUE

要插入更复杂的JSON结构，我们可以使用包中的mongo.bson.from.json函数rmongodb

library(rmongodb)
mongo <- mongo.create()
mongo.is.connected(mongo)
# [1] TRUE

db <- "test"
coll <- "test"

bs <- mongo.bson.from.JSON(js)

mongo.insert(mongo, ns = paste0(db ,".", coll), b = bs)
# [1] TRUE

注意mongodb实际存储BSON：

MongoDB 在后台以称为 BSON 的二进制编码格式表示 JSON 文档。BSON 扩展了 JSON 模型以提供额外的数据类型，并在不同语言中高效地进行编码和解码

参考：JSON 和 BSON