Doc*_*awk 9 ruby-on-rails bioinformatics
我们从事系统生物学研究.我们更喜欢使用现有的数据集,因为收集新的生物数据是昂贵的.因此,我们编写的许多脚本只不过是将一个数据集转换为另一个数据集.
最终,我们将结果放在网上 - 越来越多的期刊需要这样的东西.
因此,对我来说,尝试将Rails用于我的项目并不是一个很大的飞跃.我可以设置简单的可重复实验,逐步通过数据库表(例如使用rake)转换数据,并使用像flotomatic和gnuplot 这样的宝石显示结果.如果我需要的东西很快跑,我甚至可以用C编写自定义的宝石++使用水稻,或者使用并行八哥和workling.
最后,我开始怀疑是否有其他人正在使用Rails进行生物信息学或科学研究.
我想,"如果我是一个科学研究Rails宝石,我该怎么办？"
这样的宝石有什么额外的功能？也许迁移适应了一个可以管理的管道？也许更高级的图形功能？内置后台工作？