如何从终端运行.ipynb Jupyter笔记本？
Vin*_*ent 130 python ipython jupyter-notebook nbconvert
我在.ipynb文件中有一些代码,并且我不需要IPython Notebook的"交互"功能.我想直接从Mac终端命令行运行它.
基本上,如果这只是一个.py文件,我相信我可以从命令行执行python filename.py..ipynb文件有类似的东西吗？
min*_*nrk 138
nbconvert允许您使用--execute标志运行笔记本:
jupyter nbconvert --execute <notebook>
如果要运行笔记本并生成新笔记本,可以添加--to notebook:
jupyter nbconvert --execute --to notebook <notebook>
或者,如果要使用新输出替换现有笔记本:
jupyter nbconvert --execute --to notebook --inplace <notebook>
由于这是一个非常长的命令,您可以使用别名:
alias nbx="jupyter nbconvert --execute --to notebook"
nbx [--inplace] <notebook>
- 这会将笔记本变成静态HTML页面 (6认同)
- 可以在 https://nbconvert.readthedocs.io/en/latest/execute_api.html#module-nbconvert.preprocessors 找到文档或运行笔记本的这种和编程方式 (3认同)
- 另外，如果您有长时间运行的单元格，[您可以设置](https://nbconvert.readthedocs.io/en/latest/execute_api.html)`--ExecutePreprocessor.timeout=[timeout_in_seconds]`（使用`-1`没有任何限制）。 (2认同)
dit*_*kin 84
在命令行中,您可以使用以下命令将笔记本转换为python:
jupyter nbconvert --to python nb.ipynb
您可能必须安装python mistune包:
sudo pip install -U mistune
- 不赞成使用子命令`ipython nbconvert`来支持jupyter nbconvert (11认同)
- 我认为这个答案不正确。我意识到它可以工作，但问题是如何从终端运行.ipynb，而不是如何将其转换为.py然后运行。 (3认同)
- 如果任何单元的运行时间超过30秒，Nbconvert将失败，您可能需要添加--ExecutePreprocessor.timeout = 600。 (3认同)
小智 38
在您的终端中运行 ipython：
ipython
然后找到您的脚本并将其放在那里：
%run your_script.ipynb
- @baxx `ipython -c "%run your_script.ipynb"` (9认同)
Mur*_*mel 28
使用ipython：
ipython --TerminalIPythonApp.file_to_run=<notebook>.ipynb
通常，我更喜欢这个选项，因为它确实是自我描述的。如果您希望使用较少的字符，请使用：
ipython -c "%run <notebook>.ipynb"
- 伙计们，承认吧，如果没有这个答案，你就找不到评论，所以为什么不同时投票呢？:) (4认同)
Vij*_*hal 10
对于新版本而不是:
ipython nbconvert --to python <YourNotebook>.ipynb
你可以使用ipython的jupyter instend:
jupyter nbconvert --to python <YourNotebook>.ipynb
就我而言，最适合我的命令是：
jupyter nbconvert --execute --clear-output <notebook>.ipynb
为什么？此命令不会创建额外的文件（就像.py文件一样），并且每次执行笔记本时都会覆盖单元格的输出。
如果你运行：
jupyter nbconvert --help
--clear-output 清除当前文件的输出并保存到位，覆盖现有笔记本。
我遇到了同样的问题，我找到了papermill。与其他解决方案相比的优点是您可以在笔记本运行时看到结果。当笔记本需要很长时间时，我发现这个功能很有趣。这是非常容易使用：
pip install papermill
papermill notebook.ipynb output.ipynb
它还具有其他方便的选项，例如将输出文件保存到 Amazon S3、Google Cloud 等。有关更多信息，请参阅该页面。
现在有一个jupyter execute子命令将执行笔记本。
jupyter execute notebook.ipynb
更新作者引用的评论以获得更好的可见性：
作者的注释“这个项目在 Jupyter 的执行 API 之前开始，现在是从命令行运行笔记本的推荐方式。考虑 runipy 已弃用和未维护。” – 塞巴斯蒂安·帕尔马
安装 runipy 库，允许在终端上运行您的代码
pip install runipy
在编译你的代码之后：
runipy <YourNotebookName>.ipynb
您也可以尝试 cronjob。所有信息都在这里
- 作者的注释“这个项目在 Jupyter 的执行 API 之前开始，现在是从命令行运行笔记本的推荐方式。考虑 runipy 已弃用和未维护。” (12认同)
我对这个主题做了一些研究，并写了一篇关于在命令行中运行 Jupyter Notebook 的 4 种方法的文章，下面是我的发现的总结。
1. 使用nbconvert
nbconvert包已安装在 Jupyter Notebook 中。它可以用来执行笔记本。此外，它还有很多特点：
- 可以将笔记本导出为 PDF 或 HTML，
- 可以隐藏输出笔记本中的代码，
- 即使单元格中有错误也可以执行笔记本。
笔记本执行示例：
jupyter nbconvert --execute --to notebook --allow-errors your-notebook.ipynb
上面的命令将输出your-notebook.nbconvert.ipynb文件并执行所有单元格，即使有错误也是如此。
2. 使用papermill
Papermill允许您对笔记本进行参数化。您可以将变量定义为参数（带有单元格标签）。
命令示例：
papermill -p name Piotrek your-notebook.ipynb output-notebook.ipynb
带有注入参数的示例笔记本：
3. 手动下载笔记本作为.py脚本
有一个选项可以手动下载笔记本作为.py脚本：
下载后，您可以向文件添加执行权限并将其作为命令行脚本运行。
4. 使用jupytext
jupytext包允许您将.ipynb文件与.py文件同步。您不需要手动将笔记本转换为脚本。
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