如何彻底删除散点图周围的空白区域？

Question

我试图在图像上绘制一个散点图,周围没有任何空白区域.

如果我只绘制如下图像,那么没有空格:

fig = plt.imshow(im,alpha=alpha,extent=(0,1,1,0))
plt.axis('off')
fig.axes.axis('tight')
fig.axes.get_xaxis().set_visible(False)
fig.axes.get_yaxis().set_visible(False)

但是当我在图像上添加散点图时,如下所示:

fig = plt.scatter(sx, sy,c="gray",s=4,linewidths=.2,alpha=.5)
fig.axes.axis('tight')
fig.axes.get_xaxis().set_visible(False)
fig.axes.get_yaxis().set_visible(False)

此时,通过使用以下savefig命令,在图像周围添加了空格:

plt.savefig(im_filename,format="png",bbox_inches='tight',pad_inches=0)

关于如何去除空白区域的任何想法？

Answer 1

通过切换到mpl面向对象的样式,您可以在同一轴上绘制图像和散点图,因此只需要使用ax.imshow和设置一次空白ax.scatter.

在下面的示例中,我习惯于subplots_adjust删除轴周围的空白,并将ax.axis('tight')轴限制设置为数据范围.

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

# Load an image
im = plt.imread('stinkbug.png')

# Set the alpha
alpha = 0.5

# Some random scatterpoint data
sx = np.random.rand(100)
sy = np.random.rand(100)

# Creare your figure and axes
fig,ax = plt.subplots(1)

# Set whitespace to 0
fig.subplots_adjust(left=0,right=1,bottom=0,top=1)

# Display the image
ax.imshow(im,alpha=alpha,extent=(0,1,1,0))

# Turn off axes and set axes limits
ax.axis('tight')
ax.axis('off')

# Plot the scatter points
ax.scatter(sx, sy,c="gray",s=4,linewidths=.2,alpha=.5)

plt.show()