什么是拆卸R包的可靠过程,以便进行升级?

log*_*thy 11 r devtools install.packages

我编写了一个使用devtools来包含内部数据的包:

devtools::use_data(.data, internal = T, overwrite = T)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

我最近更改了这些数据并重建了包.我想在另一台当前加载旧软件包的机器上升级该软件包:

detach('package:myPackage', unload=T)
remove.packages('myPackage')
install.packages(repos=NULL, 'myPackage.zip')
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

我检查一下这些变化是否已经完成:

length(myPackage:::.data[[1]])
[1] 2169
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

不是我期待的......也许重启会有所帮助?

Restarting R session...
length(myPackage:::.data[[1]])
[1] 2179
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

这是预期的结果.

阅读分离的帮助表明它在某些情况下可能是片状的,例如:

如果在加载了命名空间的包上使用库,则会附加已加载的命名空间的导出.因此,分离和重新附加包可能不会刷新包的一些或所有组件,并且是不可取的.

我的情况是,我想彻底清除加载的包,以便我可以更新它.有没有办法在不重新启动R的情况下执行此操作?


编辑2016/10/28 - 使用下面的可重现示例进行更新

  • 在Windows上测试
  • 需要devtools

...

# setup package in temp dir
pkg_dir <- file.path(tempfile(), 'dummy.test.pkg')
dir.create(pkg_dir, recursive=T)
devtools::create(pkg_dir)
setwd(pkg_dir)

# read description
desc <- readChar('DESCRIPTION', file.size('DESCRIPTION'))

# create and build package v01
.testval <- c(1,2,3)
devtools::use_data(.testval, internal=T, overwrite=T)
v01 <- sub('\\d+\\.\\d+\\.\\d+\\.\\d+', '0.0.0.1', desc, perl=T)
writeChar(v01, 'DESCRIPTION')
bin01 <- devtools::build(binary=T, path='.')

# create and build package v10
.testval <- c(4,5,6)
devtools::use_data(.testval, internal=T, overwrite=T)
v01 <- sub('\\d+\\.\\d+\\.\\d+\\.\\d+', '1.0.0.0', desc, perl=T)
writeChar(v01, 'DESCRIPTION')
devtools::build(binary=T, path='.')
bin10 <- devtools::build(binary=T, path='.')

# up to this point we haven't loaded either package
sessionInfo()

# install v01
install.packages(repos=NULL, bin01)
cat(dummy.test.pkg:::.testval)
# 1 2 3 (as expected)

# unload the package
unloadNamespace('dummy.test.pkg')

# install v10
install.packages(repos=NULL, bin10)
cat(dummy.test.pkg:::.testval)
# 1 2 3 (NOT 4 5 6 which we expected)

### restart R here ###
cat(dummy.test.pkg:::.testval)
# 4 5 6 (as expected)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

Joh*_*nke 0

如果您不想重新启动 R 会话,获取新数据的安全方法是保存数据,例如通过

save(.data, "data.rda")
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

将它们复制到另一台机器上

load("data.rda")
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