Mam*_*mba 4 r knitr r-markdown
我的一位同事的文件夹/目录中有很多sql
陈述。该文件夹也由他每天更新。我想sql
为期货同事记录这些声明。但是,我正在寻找一种使该过程“自动化”的方法。我想crontab
每周使用一次并运行一个R-Markdown
文件,该文件会自动更新现有R-Markdown
文件。
我的方法如下:
path = "c:/SQL_files/"
out.file<-""
file.names <- dir(path, pattern =".sql") # here I changed `.txt` to `.sql`
for(i in 1:length(file.names)){
file <- read.csv2.sql(file.names[i],header=TRUE, sep=";", stringsAsFactors=FALSE)
out.file <- rbind(out.file, file)
}
# That second approach comes very close, but just generates a `.txt` for the first
#`.sql` file in the directory with the error:
Error in match.names(clabs, names(xi)) :
names do not match previous names
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
文件在哪里:
[1] "c:/SQL_files/first.sql"
[2] "c:/SQL_files/second.sql"
path = "c:/SQL_files/"
out.file<-""
files <- list.files(path=path, pattern="*.sql", full.names=T, recursive=FALSE)
for(i in 1:length(files)){
file <- read.table(files[i],header=TRUE, sep=";", stringsAsFactors=FALSE)
out.file <- rbind(out.file, file)
}
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
在loop
该提取的内容.sql
不似乎以捕获所有的内容(在第一个例子)或捕获在目录(第二实例)该第一文件的只是内容。所以我的问题。有没有办法从中提取内容SQL Text File (.sql)
?可能会导致 .txt/.Rmd
以下情况:(但不一定):
第一个循环的输出: my_sql_statement.sql
第二个循环的输出: Select * From Data
这个RMD文件生成一个markdown / HTML文档,列出了一些元数据和所有指定文件的内容:
---
title: "Collection of SQL files"
author: "SQLCollectR"
date: "`r format(Sys.time(), '%Y-%m-%d')`"
output:
html_document:
keep_md: yes
---
```{r setup, echo = FALSE}
library(knitr)
path <- "files/"
extension <- "sql"
```
This document contains the code from all files with extension ``r extension`` in ``r paste0(getwd(), "/", path)``.
```{r, results = "asis", echo = FALSE}
fileNames <- list.files(path, pattern = sprintf(".*%s$", extension))
fileInfos <- file.info(paste0(path, fileNames))
for (fileName in fileNames) {
filePath <- paste0(path, fileName)
cat(sprintf("## File `%s` \n\n### Meta data \n\n", fileName))
cat(sprintf(
"| size (KB) | mode | modified |\n|---|---|---|\n %s | %s | %s\n\n",
round(fileInfos[filePath, "size"]/1024, 2),
fileInfos[filePath, "mode"],
fileInfos[filePath, "mtime"]))
cat(sprintf("### Content\n\n```\n%s\n```\n\n", paste(readLines(filePath), collapse = "\n")))
}
```
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
所有工作都在for
循环中完成,该循环遍历path
名称以结尾的所有文件extension
。对于每个文件,打印带有“元数据”的表,然后打印实际的文件内容。使用file.info
文件大小,模式和最后修改的时间戳来检索元数据。
cat(sprintf(...
包含markdown 的结构使代码看起来很复杂,但实际上很简单。
将SQL文件与来自此答案的 SQL语句结合使用,以上RMD文件将生成以下输出(使用HTML作为输出格式):