如何将 RDKit 添加到 PyCharm 中的项目？

Question

所以，我正在尝试将 RDKit 添加到我在 PyCharm 中的项目中。我发现如果您使用解释器，/usr/bin/python2.7PyCharm 会尝试使用pip. 而 RDKit 需要conda. 我试图将解释器更改为conda，但RDKit要么不在列表中，要么无法打开带有 repo 的 URL。有谁知道如何解决这个问题？

顺便说一句，在安装东西的同时，是否有可能让解释器/usr/bin/python2.7使用其他任何东西（不是pip）？

Answer 1

我终于找到了如何做到这一点，这并不难：

1. 安装康达；
2. 按照这些说明安装 RDKit
3. 像这样转到 PyCharm 中的首选项：

或者像这样（你需要一个扳手）：

4. 在项目解释器中选择：~/anaconda/envs/my-rdkit-env/bin/python

5. 确保添加或更新相应的python路径到PATH，否则将无法工作。

测试：

1. 尝试安装 fiona - 成功，所以对安装没有影响；
2. 尝试了简单的代码：print('HELLO WORLD!')- 工作

3. 试过rdkit代码

       from rdkit import Chem
   
   
       m = Chem.MolFromSmiles('Cc1ccccc1')
   
       print(m)
   

工作，日志： <rdkit.Chem.rdchem.Mol object at 0x101125080>