没有使用RMySQL选择数据库

Question

我正在尝试连接到远程可公开访问的MySQL服务器EnsEMBL公共服务器RMySQL,但是当我尝试列出表时,会发生错误:

library(RMySQL)

mydb = dbConnect(MySQL(), 
                 user = 'anonymous',
                 port = 5306,
                 host = 'asiadb.ensembl.org')

dbListTables(mydb)

Error in .local(conn, statement, ...) : 
  could not run statement: No database selected

有没有办法找出这个名字？或者我是否完全犯了一个完全不同的错误？

Answer 1

您必须在dbConnect调用中指定db的名称.例如:

mydb = dbConnect(MySQL(), 
                 user = 'anonymous',
                 port = 5306,
                 host = 'asiadb.ensembl.org',
                 db = 'homo_sapiens_core_83_38')

dbListTables(mydb)