如何将图像上传到RStudio Notebook？

Question

有谁知道如何将(工作)目录中的png图像导入/上传到RStudio Notebook脚本中？我喜欢将它包含在Notebook的HTML输出中.Rmarkdown中建议的脚本(http://rmarkdown.rstudio.com/authoring_basics.html)在Notebook中不起作用.

这是我使用/创建的一些代码:

#' Plot pathways using the bioconductor *pathview* package. Five *.png images are placed in the working directory by default.
>p <- pathview(gene.data=foldchanges, pathway.id=keggresids, species="hsa"))
>str(p)

'str(p)'的日志是5的列表(每个路径一个),每个包含一个data.frame plot.data.gene,包含10个变量和一个plot.data.cpd:NULL

可以使用路径视图插图的第3-6页上的示例(https://www.bioconductor.org/packages/3.3/bioc/vignettes/pathview/inst/doc/pathview.pdf).

由于图像打印到工作目录,因此它不会显示在我的Notebook HTML中.有没有办法将图像导回到文档中,以便将其呈现到HTML文档中？我没有在markdown文档中工作,但在一个常规的R脚本中,我通过选择Notebook图标(或ctrl + shift + K)编译成HTML Notebook,因此下面的markdown脚本将不起作用:

![imagename](/images/file.png)

有什么建议？

Answer 1

嗯,这是你想要的吗？只需将png插入R markdown文件中？

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title: "Crab"
output: html_document
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#![Here is a Crab](Crab.png)

You can also embed plots, for example:

```{r, echo=FALSE}
plot(cars)
```