Spark应用程序 - Java.lang.OutOfMemoryError:Java堆空间

Question

我使用的是Spark Standalone单机,128G内存和32个内核.以下是我认为与我的问题相关的设置:

spark.storage.memoryFraction     0.35
spark.default.parallelism        50
spark.sql.shuffle.partitions     50

我有一个Spark应用程序,其中有一个1000个设备的循环.对于每个循环(设备),它准备特征向量,然后调用MLLib的k-Means.在循环的第25到第30次迭代(处理第25到第30个设备)时,它遇到"Java.lang.OutOfMemoryError:Java堆空间"的错误.

我尝试将memoryFraction从0.7增加到0.35,但它没有帮助.我也尝试并行/分区到200没有运气.JVM选项为"-Xms25G -Xmx25G -XX:MaxPermSize = 512m".我的数据大小只有2G左右.

这是堆栈跟踪:

java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space
  at java.util.Arrays.copyOf(Arrays.java:2271)
  at java.io.ByteArrayOutputStream.grow(ByteArrayOutputStream.java:118)
  at java.io.ByteArrayOutputStream.ensureCapacity(ByteArrayOutputStream.java:93)
  at java.io.ByteArrayOutputStream.write(ByteArrayOutputStream.java:153)
  at java.io.ObjectOutputStream$BlockDataOutputStream.write(ObjectOutputStream.java:1841)
  at java.io.ObjectOutputStream.defaultWriteFields(ObjectOutputStream.java:1533)
  at java.io.ObjectOutputStream.writeSerialData(ObjectOutputStream.java:1508)
  at java.io.ObjectOutputStream.writeOrdinaryObject(ObjectOutputStream.java:1431)
  at java.io.ObjectOutputStream.writeObject0(ObjectOutputStream.java:1177)
  at java.io.ObjectOutputStream.writeObject(ObjectOutputStream.java:347)
  at scala.collection.mutable.HashMap$$anonfun$writeObject$1.apply(HashMap.scala:138)
  at scala.collection.mutable.HashMap$$anonfun$writeObject$1.apply(HashMap.scala:136)
  at scala.collection.mutable.HashTable$class.foreachEntry(HashTable.scala:230)
  at scala.collection.mutable.HashMap.foreachEntry(HashMap.scala:40)
  at scala.collection.mutable.HashTable$class.serializeTo(HashTable.scala:125)
  at scala.collection.mutable.HashMap.serializeTo(HashMap.scala:40)
  at scala.collection.mutable.HashMap.writeObject(HashMap.scala:136)
  at sun.reflect.GeneratedMethodAccessor116.invoke(Unknown Source)
  at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:43)
  at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:606)
  at java.io.ObjectStreamClass.invokeWriteObject(ObjectStreamClass.java:988)
  at java.io.ObjectOutputStream.writeSerialData(ObjectOutputStream.java:1495)
  at java.io.ObjectOutputStream.writeOrdinaryObject(ObjectOutputStream.java:1431)
  at java.io.ObjectOutputStream.writeObject0(ObjectOutputStream.java:1177)
  at java.io.ObjectOutputStream.defaultWriteFields(ObjectOutputStream.java:1547)
  at java.io.ObjectOutputStream.writeSerialData(ObjectOutputStream.java:1508)
  at java.io.ObjectOutputStream.writeOrdinaryObject(ObjectOutputStream.java:1431)
  at java.io.ObjectOutputStream.writeObject0(ObjectOutputStream.java:1177)
  at java.io.ObjectOutputStream.defaultWriteFields(ObjectOutputStream.java:1547)
  at java.io.ObjectOutputStream.writeSerialData(ObjectOutputStream.java:1508)
  at java.io.ObjectOutputStream.writeOrdinaryObject(ObjectOutputStream.java:1431)
  at java.io.ObjectOutputStream.writeObject0(ObjectOutputStream.java:1177)

一开始,应用程序看起来很好,但是在它运行一段时间并处理越来越多的设备之后,Java堆逐渐被占用并且JVM不会释放内存.如何诊断和解决这样的问题？

Answer 1

除了驱动程序和执行程序的内存外，建议尝试以下选项：-

1. 切换到KRYO序列化- http://spark.apache.org/docs/latest/tuning.html#data-serialization
2. 使用MEMORY_AND_DISK_SER_2保持RDD持久性。

另外，如果您可以发布代码，那就太好了。

Answer 2

您始终可以使用VisualVM等分析器工具。监控内存增长。希望您使用的是 64 位 JVM 而不是 32 位 JVM。32位进程只能使用2GB内存，因此内存设置基本上没有用处。希望这可以帮助