Python setuptools不包括C ++标准库标头

Question

我正在尝试将Python包装器编译为我编写的小型C ++库。我编写了以下setup.py脚本以尝试setuptools用于编译包装器：

from setuptools import setup, Extension
import numpy as np
import os

atmcmodule = Extension(
    'atmc',
    include_dirs=[np.get_include(), '/usr/local/include'],
    libraries=['mcopt', 'c++'],  # my C++ library is at ./build/libmcopt.a
    library_dirs=[os.path.abspath('./build')],
    sources=['atmcmodule.cpp'],
    language='c++',
    extra_compile_args=['-std=c++11', '-v'],
    )

setup(name='tracking',
      version='0.1',
      description='Particle tracking and MC optimizer module',
      ext_modules=[atmcmodule],
      )

但是，当我python setup.py build在OS X El Capitan上运行时，clang抱怨找不到某些C ++标准库头文件：

In file included from atmcmodule.cpp:7:
In file included from ./mcopt.h:11:
In file included from ./arma_include.h:4:
/usr/local/include/armadillo:54:12: fatal error: 'initializer_list' file not found
  #include <initializer_list>
           ^
1 error generated.
error: command 'gcc' failed with exit status 1

将-v标志传递给编译器表明，它正在搜索以下包含路径：

#include <...> search starts here:
 /Users/[username]/miniconda3/include
 /Users/[username]/miniconda3/lib/python3.4/site-packages/numpy/core/include
 /usr/local/include
 /Users/[username]/miniconda3/include/python3.4m
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.11.sdk/usr/include/c++/4.2.1
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.11.sdk/usr/include/c++/4.2.1/backward
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin/../lib/clang/7.0.0/include
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/include
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.11.sdk/usr/include
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.11.sdk/System/Library/Frameworks (framework directory)
End of search list.

显然，这不包括C ++标准库标头的路径。如果我使用该-v选项编译一个小型测试C ++源代码，则可以看到clang++通常也搜索该路径/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin/../include/c++/v1，并且如果我在脚本中的include_dirs选项中包含此路径，则扩展模块可以正确编译并正常工作。但是，将此路径硬编码到脚本中似乎不是一个好的解决方案，因为该模块也需要在Linux上工作。Extensionsetup.py

因此，我的问题是如何正确地setuptools包含所需的标头？

更新（11/22/2015）

至于setuptools试图编译的扩展，它打印它的运行的第一个命令：

gcc -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -I/Users/[username]/miniconda3/include -arch x86_64 -I/Users/[username]/miniconda3/lib/python3.4/site-packages/numpy/core/include -I/Users/[username]/Documents/Code/ar40-aug15/monte_carlo/mcopt -I/usr/local/include -I/Users/[username]/miniconda3/include/python3.4m -c /Users/[username]/Documents/Code/ar40-aug15/monte_carlo/atmc/atmcmodule.cpp -o build/temp.macosx-10.5-x86_64-3.4/Users/[username]/Documents/Code/ar40-aug15/monte_carlo/atmc/atmcmodule.o -std=c++11 -fopenmp -v

如果我将此命令粘贴到终端中并自己运行，则扩展会成功编译。因此，我怀疑是setuptools在修改一些我不知道的环境变量，还是在对其实际运行的命令稍加说谎。

Answer 1

Setuptools尝试使用与编译Python解释器相同的标志来编译C / C ++扩展模块。在检查了用于编译我的Python安装程序（来自Anaconda）的标志后，我发现它正在针对最低Mac OS X版本10.5进行编译。这似乎使其使用GCC libstdc ++而不是clang的libc ++（支持C ++ 11）。

可以通过将环境变量设置MACOSX_DEPLOYMENT_TARGET为10.9（或更高版本）或添加到来'-mmacosx-version-min=10.9'解决此问题extra_compile_args。