在Anaconda中安装Python模块的开发版本的最佳实践是什么？

Question

我在Mac上使用Anaconda python发行版.我想在Github上使用最新版本的matplotlib源代码,进行一些更改,看看它是如何运行的.但是大多数时候我只想使用Anaconda Python附带的matplotlib的正常版本,所以我想要一种方便来回切换的方法.

matplotlib文档对分支和pull-request工作流程有一个很好的描述,但我不清楚我是如何实际安装和使用matplotlib的开发版本的,这将保留我正在运行的Python实现.

我的猜测是我想要建立一个包含最新matplotlib版本及其依赖关系的环境,并在该环境和正常root环境之间切换.但是当我python setup.py develop用来安装matplotlib的开发版本时,它似乎安装到两个环境中.

那么,使用GitHub的Python包的开发版本的最佳实践是什么？

Answer 1

正如您在问题中提到的那样，conda env它能够为要使用的任何软件包的开发版本维护单独的Python环境。

我不太确定为什么您会发现python setup.py develop在您的root环境中安装了matplotlib的开发版本。也许您创建了一个新环境，但是在安装matplotlib的开发版本之前没有激活它？例如：

~$ conda create --name matplotlib-dev --clone root
Fetching package metadata: ....
src_prefix: '/home/alistair/anaconda'
dst_prefix: '/home/alistair/anaconda/envs/matplotlib-dev'
Packages: 165
Files: 32
Linking packages ...
[      COMPLETE      ]|#####################################################| 100%
#
# To activate this environment, use:
# $ source activate matplotlib-dev
#
# To deactivate this environment, use:
# $ source deactivate
#
~$ conda info --envs 
# conda environments:
#
matplotlib-dev           /home/alistair/anaconda/envs/matplotlib-dev
root                  *  /home/alistair/anaconda

至此，我已经创建了一个matplotlib-dev环境，但尚未激活它，因此安装任何新软件包仍会修改我的root环境。

~$ source activate matplotlib-dev
discarding /home/alistair/anaconda/bin from PATH
prepending /home/alistair/anaconda/envs/matplotlib-dev/bin to PATH

(matplotlib-dev)~$ conda info --envs 
# conda environments:
#
matplotlib-dev        *  /home/alistair/anaconda/envs/matplotlib-dev
root                     /home/alistair/anaconda

无论如何，不再建议直接使用setuptools（即python setup.py install或python setup.py develop），并且numpy等的将来版本可能不支持。

首选方法是使用pip install <path>，或者pip install -e <path>如果您想要“可编辑”的安装（类似于python setup.py develop为您提供的安装）：

(matplotlib-dev)~$ pip install -e git+git://github.com/matplotlib/matplotlib.git#egg=matplotlib-dev
Obtaining matplotlib from git+git://github.com/matplotlib/matplotlib.git#egg=matplotlib-dev
  Cloning git://github.com/matplotlib/matplotlib.git to ./src/matplotlib
...
Installing collected packages: matplotlib
  Running setup.py develop for matplotlib
Successfully installed matplotlib-1.5.0+337.g595868a

(matplotlib-dev)~$ python -c "import matplotlib; print(matplotlib.__version__)"
1.5.0.post337+g595868a

(matplotlib-dev)~$ source deactivate
discarding /home/alistair/anaconda/envs/matplotlib-dev/bin from PATH

~$ python -c "import matplotlib; print(matplotlib.__version__)"
1.4.3

请注意该#egg=部分，该部分告诉pip您将源代码安装到./src/matplotlib-dev。如果您已经获得了当前正在使用的本地副本，则git也可以将pip路径传递到本地源目录，而不是URI 。

似乎也可以使用conda develop <path>代替pip install -e <path>，尽管conda似乎不像以前那样提供集成的VCS支持pip。