我有一个看起来像这样的数据框.
> head(df)
DGene JGene cdr3_len Sum
1 IGHD1 IGHJ1 0 22
2 IGHD1 IGHJ1 1 11
3 IGHD1 IGHJ1 2 16
4 IGHD1 IGHJ1 3 40
5 IGHD1 IGHJ1 4 18
6 IGHD1 IGHJ1 5 30
...
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facet_grid非常简单.
ggplot(df,aes(x=cdr3_len,y=Sum)) + geom_line() + xlim(c(1,42)) + facet_grid(JGene~DGene,scales="free_y")
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并得到一些看起来像的东西.
我想知道是否有人可以帮我添加每个网格的平均值的hline.或者可能如何在右上角打印每个网格的平均值.
谢谢,
编辑 - 数据框的完整链接
这是一种cdr3_len通过预先计算所需值来为平均值添加文本和垂直线的方法(根据@jwillis0720的注释):
首先,计算cdr3_len每个面板的平均值,然后计算left_join该数据框到第二个数据框,该数据框计算用于将文本放置在每个面板上的适当y值(因为适当的y值仅根据级别变化JGene).
library(dplyr)
meanData = df %>% group_by(JGene, DGene) %>%
summarise(meanCDR = sum(Sum*cdr3_len)/sum(Sum)) %>%
left_join(df %>% group_by(JGene) %>%
summarise(ypos = 0.9*max(Sum)))
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现在为情节:
ggplot(df,aes(x=cdr3_len, y=Sum)) +
geom_vline(data=meanData, aes(xintercept=meanCDR), colour="red", lty=3) +
geom_line() +
geom_text(data=meanData,
aes(label=round(meanCDR,1), x=40, y=ypos), colour="red",
hjust=1) +
xlim(c(1,42)) +
facet_grid(JGene~DGene,scales="free_y")
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