创建DNA序列的互补序列并将其反转C ++

Question

因此，我尝试创建序列TGAGACTTCAGGCTCCTGGGCAACGTGCTGGTCTGTGTGC的补码，但是我的输出未按预期工作。序列中每个字母的补码为
A-> T
G-> C
C-> G
T-> A

我从事Java编程已经有一年多了，所以我对C ++中的指针真的很生疏，我猜问题出在反向方法中，并且在每次调用函数时都改变了指针的方式

#include<stdio.h>
#include<iostream>
using namespace std;

void reverse(char s[]);

int main() {
    char s[40] = {'T','G','A','G','A','C','T','T','C','A','G','G','C','T','C','C','T','G','G','G','C','A','A','C','G','T','G','C','T','G','G','T','C','T','G','T','G','T','G'};

    cout << "DNA sequence: "<< endl << s << endl;

    reverse(s);

    cout << "Reverse Compliment: "<< endl << s << endl;



    system("pause");
}

void reverse(char s[])
{
    char c;
    char *p, *q;

    p = s;

    if (!p)
        return;

    q = p + 1;
    if (*q == '\0')
        return;

    c = *p;
    reverse(q);

    switch(c) {
        case 'A':
            *p = 'T';
            break;
        case 'G':
            *p = 'C';
            break;
        case 'C':
            *p = 'G';
            break;
        case 'T':
            *p = 'A';
            break;  
    }
    while (*q != '\0') {
        *p = *q;
        p++;
        q++;
    }

    *p = c;

    return;
}

Answer 1

标准的现代C ++使得这种底层的，面向指针的编程变得不必要了（实际上，您实际上是在编写C）。

一旦有了一个说complement将核苷酸转换成其互补序列的函数，您只需应用一些标准库函数即可transform。

这是C ++ 11中的程序重写：

#include <string>
#include <iostream>                                                                                                                                                                                          
#include <algorithm>
#include <cassert>


using namespace std;


char complement(char n)
{   
    switch(n)
    {   
    case 'A':
        return 'T';
    case 'T':
        return 'A';
    case 'G':
        return 'C';
    case 'C':
        return 'G';
    }   
    assert(false);
    return ' ';
}   


int main() 
{   
    string nucs = "ACAATTGGA";
    transform(
        begin(nucs),
        end(nucs),
        begin(nucs),
        complement);
    cout << nucs << endl;
}