如何更改和设置Rcpp编译参数

Question

我创建了一个新Rcpp包(使用RStudio).该包包含一个C++函数,该函数使用以下编译器选项进行编译:

clang ++ -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG -I/usr/local/include -I/usr/local/include/freetype2 -I/opt/X11/include -I"/ Library/Frameworks /R.framework/Versions/3.2/Resources/library/Rcpp/include"-fPIC -Wall -mtune = core2 -g -O2 -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o

我想更改/设置这些参数,例如删除-g,添加-std=c++11和更改参数-O2来-O3.此外,最好有一次指定这些更改(对于包).

Answer 1

完成编写 R 扩展，第 1.2 节，似乎您应该能够使用几个 shell 脚本来处理这个问题。作为一个最小的例子，（在 Linux 机器上工作），我从 中创建了一个基本包Rcpp::Rcpp.package.skeleton，并将以下两个文件放在项目根目录中：

配置

#!/bin/bash
if [ ! -d "~/.R" ]; then
  mkdir ~/.R; touch ~/.R/Makevars
  echo "CXXFLAGS= -O3 -std=c++11 -Wall -mtune=core2" > ~/.R/Makevars
elif [ ! -e "~/.R/Makevars" ]; then
  touch ~/.R/Makevars
  echo "CXXFLAGS= -O3 -std=c++11 -Wall -mtune=core2" > ~/.R/Makevars
else
  mv ~/.R/Makevars ~/.R/Makevars.bak_CustomConfig
  echo "CXXFLAGS= -O3 -std=c++11 -Wall -mtune=core2" > ~/.R/Makevars
fi

清理

#!/bin/bash
if [ -e "~/.R/Makevars.bak_CustomConfig" ]; then
  mv -f ~/.R/Makevars.bak_CustomConfig ~/.R/Makevars
fi

然后使它们可执行（chmod 777 path/to/project/root/configure和chmod 777 path/to/project/root/cleanup）。当我运行 Build 和 Reload 时，我得到了（摘录）：

g++ -m64 -I/usr/include/R -DNDEBUG  
-I/usr/local/include 
-I"/home/nr07/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.2/Rcpp/include"  
-fpic  -O3 -std=c++11 -Wall -mtune=core2
-c rcpp_hello.cpp -o rcpp_hello.o

g++ -m64 -shared -L/usr/lib64/R/lib 
-Wl,-z,relro -o CustomConfig.so RcppExports.o rcpp_hello.o 
-L/usr/lib64/R/lib -lR

它覆盖了 R Makevars 默认值，并使用正确的选项。

这只是一个基本示例，因此根据您的目标，您可能希望更进一步：

1. 为不同平台（例如 Unix/Linux 与 Windows/Windows 64 位）调整脚本，我相信在链接的文章中提到了这一点。
2. 确保从您的机器设置文件的权限足以让这些文件在不同的计算机上执行（我认为它会起作用，但我并不完全肯定）。