可以将边缘列表导入igraph python

Question

我要导入到iGraph的文本文件中有一个Twitter关注者列表。

这是我的清单样本

393795446 18215973
393795446 582203919
393795446 190709835
393795446 1093090866
393795446 157780872
393795446 1580109739
393795446 3301748909
393795446 1536791610
393795446 106170345
393795446 9409752

这就是我导入的方式

from igraph import *
twitter_igraph = Graph.Read_Edgelist('twitter_edgelist.txt', directed=True)

但是我得到这个错误。

---------------------------------------------------------------------------
InternalError                             Traceback (most recent call last)
<ipython-input-10-d808f2237fa8> in <module>()
----> 1 twitter_igraph = Graph.Read_Edgelist('twitter_edgelist.txt', directed=True)

InternalError: Error at type_indexededgelist.c:369: cannot add negative number of vertices, Invalid value

我不确定为什么要说负数。我检查了文件，它没有任何负数或ID。

Answer 1

您需要使用graph.Read_Ncol这种类型的文件格式。为什么您的文件不符合典型的“边缘列表”格式，这超出了我的范围。我本人对此很纳闷。我还应该提到，我从这里得到了答案。塔马斯（Tamàs）似乎是这里附近的主要文字画家。我敢肯定，对于您为什么需要使用Ncol而不是，他可以给出更详细的理由Edgelist。

这对我有用。

from igraph import *
twitter_igraph = Graph.Read_Ncol('twitter_edgelist.txt', directed=True)

个人插头

这是可以改进igraph文档的一个很好的例子。

例如：唯一带有graph.Read_Edgelist（）doc的文字说...

从文件中读取边缘列表，并基于该列表创建图形。请注意，顶点索引从零开始。

当显然在文件格式方面存在细微差别时，这并没有告诉我任何信息。如果说此功能期望文件采用哪种格式，则可以节省很多人的精力。