cha*_*com 5 precision matlab numpy fft scipy
我一直在做一个程序,它使用 NumPy/Scipy 测量两个光谱之间的相位差。
我已经有了用 Matlab 编写的例程,所以我基本上使用 NumPy 重新实现了该函数和相应的单元测试。但是,我发现单元测试失败是因为scipy.fftpack.fft引入了一些小的数值错误:
import numpy as np
import scipy.fftpack.fft
x = np.array([0.0, 1.0, 2.0, 3.0, 4.0, 3.0, 2.0, 1.0])
X = scipy.fftpack.fft(x)
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在这种情况下,由于时域信号是对称的,因此预期输出为
[16.0000 -6.8284 0 -1.1716 0 -1.1716 0 -6.8284]
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如以下Matlab代码所示:
>> x = [0.0, 1.0, 2.0, 3.0, 4.0, 3.0, 2.0, 1.0];
>> X = fft(x)
X =
16.0000 -6.8284 0 -1.1716 0 -1.1716 0 -6.8284
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根据 DSP 理论,结果不应包含任何虚部。但是,scipy 结果如下:
array([ 16.00000000 +0.00000000e+00j, -6.82842712 -2.22044605e-16j,
0.00000000 -0.00000000e+00j, -1.17157288 -2.22044605e-16j,
0.00000000 +0.00000000e+00j, -1.17157288 +2.22044605e-16j,
0.00000000 +0.00000000e+00j, -6.82842712 +2.22044605e-16j])
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为什么要scipy.fftpack.fft引入小的虚部?我真的很想避免这个问题。谁能给我一个建议?
一方面,scipy.fftpack.fft是保证总是返回一个复杂的结果,而MATLAB的结果fft的功能有时是真实的,有时是复杂的,这取决于是否有非零虚部。但是,这并不能解释为什么 的结果scipy.fftpack.fft实际上包含非零虚部,而 MATLABfft函数的结果却没有。
我怀疑差异的根本原因与 MATLAB 的fft函数显然基于FFTW的事实有关,而 scipy 和 numpy由于许可限制而使用FFTPACK。
pyfftw但是,确实提供了到 FFTW 的 Python 绑定。如果我们比较 FFTPACK 和 FFTW 结果的虚部:
from pyfftw.interfaces import scipy_fftpack as fftw
Fx1 = fftpack.fft(x)
print(Fx1.imag)
# [ 0.00000000e+00 -2.22044605e-16 -0.00000000e+00 -2.22044605e-16
# 0.00000000e+00 2.22044605e-16 0.00000000e+00 2.22044605e-16]
print(Fx1.imag == 0)
# [ True False True False True False True False]
Fx2 = fftw.fft(x)
print(Fx2.imag)
# [ 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0. 0.]
print(Fx2.imag == 0)
# [ True True True True True True True True]
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我们看到 FFTW 结果的虚部比较正好等于 0,而 FFTPACK 有少量的浮点舍入误差。
除此之外,我不知道为什么 FFTW 的实现比 FFTPACK 受到的舍入误差更少,但在任何情况下,重要的是要注意这些舍入误差足够小,它们通常不会引起问题(你知道你不应该测试浮点值之间的精确相等,对吗?)。
通常你会简单地取结果的真实部分,例如:
scipy.fftpack.fft(x).real
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如果这些错误是一个问题,那么您可以切换到 usingpyfftw而不是 numpy/scipy,但是如果您的代码对舍入错误如此敏感,那么这可能意味着您无论如何都做错了。