如何让 R 使用更多 CPU 使用率？

Question

我注意到 R 并没有使用我所有的 CPU，我想极大地增加它（向上到 100%）。我不希望它只是并行化几个函数；我希望 R 使用更多的 CPU 资源。我正在尝试使用 lp() 函数运行纯 IP 集打包程序。目前，我运行 Windows，并且我的计算机上有 4 个内核。

我曾尝试用雪、doParallel 和 foreach 进行试验（虽然我不知道我真的在用它们做什么）。

在我的代码中，我有这个......

library(foreach)
library(doParallel)
library(snowfall)

cl <- makeCluster(4)
registerDoParallel(cl)

sfInit(parallel = TRUE, cpus = 4)


#code that is taking a while to run but does not involve simulations/iterations

lp (......, all.int = TRUE)

sfStop()

R 卡住并运行 lp() 很长时间。我的 CPU 大约是 25%，但我怎样才能增加它？

Answer 1

如果您尝试并行运行 4 个不同的 LP，以下是在 snowfall.

sfInit(parallel=TRUE, cpus=4)
sfSource(code.R) #if you have your function in a separate file
sfExport(list=c("variable1","variable2",
            "functionname1")) #export your variables and function to cluster
results<-sfClusterApplyLB(parameters, functionname) #this starts the function on the clusters

例如，sfClusterApply 中的函数可以包含您的 LP。

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