在R中填充矩阵

Question

我在R中有一个预分配的矩阵,需要用来自具有以下格式的文件生成的数据帧中的数据填充它:

1-1-7  
1-3-2  
2-2-6  
1-4-8  
....

其中第一列包含行索引,第二列包含列索引,第三列包含值.

以下循环是否有更快/更好的方式？

    for(i in 1:nrow(file)){  
    matrix[file[i,1],file[i,2]]=file[i,3]
    }

Answer 1

使用row/colindex作为第一列和第二列,file并使用这些索引指定file[,3]to m1.

m1[as.matrix(file[1:2])] <- file[,3]
m1
#     [,1] [,2] [,3] [,4]
#[1,]    7    0    2    8
#[2,]    0    6    0    0

如上所述,我们根据行/列索引分配值.如果我们取前两列并转换为矩阵,则第一列充当行索引,第二列充当列索引

 as.matrix(file[1:2])
 #     v1 v2
 #[1,]  1  1
 #[2,]  1  3
 #[3,]  2  2
 #[4,]  1  4

如果我们m1基于第一行进行子集化,即1 1,我们得到的行为m1at row = 1和column = 1,类似于第二行,它将是row = 1和column = 3的元素,依此类推.在这里,我们创建了一个0具有指定尺寸的矩阵.因此,基于行/列位置的4个值将是0

m1[as.matrix(file[1:2])]
#[1] 0 0 0 0

现在,我们通过将值分配给'file'的第3列来更改/替换指定行/列位置的'm1'中的值

 m1[as.matrix(file[1:2])] <- file[,3]

如果我们检查指定位置的值,它将被替换

 m1[as.matrix(file[1:2])] 
 #[1] 7 2 6 8

或者我们可以使用使用另一种方法sparseMatrix,从library(Matrix)

library(Matrix)
sM <- sparseMatrix(file[,1], file[,2], x=file[,3])
as.matrix(sM)
#      [,1] [,2] [,3] [,4]
#[1,]    7    0    2    8
#[2,]    0    6    0    0

数据

file <- structure(list(v1 = c(1L, 1L, 2L, 1L), v2 = c(1L, 3L, 2L, 4L), 
v3 = c(7, 2, 6, 8)), .Names = c("v1", "v2", "v3"), 
 class = "data.frame", row.names = c(NA, -4L))

m1 <- matrix(0, nrow=max(file[,1]), ncol=max(file[,2]))