And*_*ndy 21 python numpy pool multiprocessing ioerror
我IOError: bad message length在向map函数传递大参数时得到了一个.我怎么能避免这个?我设置N=1500或更大时会发生错误.
代码是:
import numpy as np
import multiprocessing
def func(args):
i=args[0]
images=args[1]
print i
return 0
N=1500 #N=1000 works fine
images=[]
for i in np.arange(N):
images.append(np.random.random_integers(1,100,size=(500,500)))
iter_args=[]
for i in range(0,1):
iter_args.append([i,images])
pool=multiprocessing.Pool()
print pool
pool.map(func,iter_args)
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在文档中multiprocessing有recv_bytes一个引发IOError 的函数.可能是因为这个吗?(https://python.readthedocs.org/en/v2.7.2/library/multiprocessing.html)
编辑
如果我使用imagesnumpy数组而不是列表,我得到一个不同的错误:SystemError: NULL result without error in PyObject_Call.有点不同的代码:
import numpy as np
import multiprocessing
def func(args):
i=args[0]
images=args[1]
print i
return 0
N=1500 #N=1000 works fine
images=[]
for i in np.arange(N):
images.append(np.random.random_integers(1,100,size=(500,500)))
images=np.array(images) #new
iter_args=[]
for i in range(0,1):
iter_args.append([i,images])
pool=multiprocessing.Pool()
print pool
pool.map(func,iter_args)
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EDIT2我使用的实际功能是:
def func(args):
i=args[0]
images=args[1]
image=np.mean(images,axis=0)
np.savetxt("image%d.txt"%(i),image)
return 0
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此外,iter_args不包含相同的图像集:
iter_args=[]
for i in range(0,1):
rand_ind=np.random.random_integers(0,N-1,N)
iter_args.append([i,images[rand_ind]])
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Jos*_*edy 11
您正在创建一个池并将所有图像一次性发送到func().如果你可以同时处理单个图像,尝试这样的事情,在35秒内使用Python 2.7.10为N = 10000完成运行:
import numpy as np
import multiprocessing
def func(args):
i = args[0]
img = args[1]
print "{}: {} {}".format(i, img.shape, img.sum())
return 0
N=10000
images = ((i, np.random.random_integers(1,100,size=(500,500))) for i in xrange(N))
pool=multiprocessing.Pool(4)
pool.imap(func, images)
pool.close()
pool.join()
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这里的关键是使用迭代器,因此您不必一次将所有数据保存在内存中.例如,我将包含所有数据的数组中的图像转换为生成器表达式,以便仅在需要时创建图像.你可以修改它来从磁盘或其他任何东西加载你的图像.我还使用了pool.imap而不是pool.map.
如果可以,请尝试在worker函数中加载图像数据.现在,您必须序列化所有数据并将其发送到另一个流程.如果您的图像数据较大,这可能是一个瓶颈.
[现在我们知道func必须立即处理所有图像]
你可以对你的图像做一个迭代的意思.这是一个不使用多处理的解决方案.要使用多处理,您可以将图像划分为块,并将这些块存储到池中.
import numpy as np
N=10000
shape = (500,500)
def func(images):
average = np.full(shape, 0)
for i, img in images:
average += img / N
return average
images = ((i, np.full(shape,i)) for i in range(N))
print func(images)
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这就是解决问题的方法:将图像声明为全局的。
import numpy as np
import multiprocessing
N=1500 #N=1000 works fine
images=[]
for i in np.arange(N):
images.append(np.random.random_integers(1,100,size=(500,500)))
def func(args):
i=args[0]
images=images
print i
return 0
iter_args=[]
for i in range(0,1):
iter_args.append([i])
pool=multiprocessing.Pool()
print pool
pool.map(func,iter_args)
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