使用R栅格进行交互式绘图:鼠标悬停时的值

Question

我想在R中做一个小程序,用于交互式可视化和修改一些栅格数据集,看作彩色图像.用户应该打开一个文件(从终端可以),绘制它,用鼠标点击选择要编辑的点,然后插入新值.

到目前为止,我很容易实现.我使用包中的plot()函数raster来显示图,然后click()选择点并通过终端编辑它们的值.

我想添加在鼠标上显示值的功能.我已经搜索了如何做到这一点的方法,但这似乎不适用于标准的R包.它是否正确？

在这种情况下,我可能被迫使用外部包,例如gGobi,iPlots,Shiny或Plotly.但是,我更喜欢KISS并且只使用"标准"图形工具,例如栅格plot()函数或格子图形对象(例如来自rasterVis).

我理解一个Shiny应用程序可能是最好的,但它需要大量的时间来学习和完善.

Answer 1

使用leaflet和mapview您可以实现以下目标：

library(raster)
library(mapview)
library(leaflet)

f <- system.file("external/test.grd", package="raster")
r <- raster(f)

leaflet() %>% 
  addRasterImage(r, layerId = "values") %>% 
  addMouseCoordinates() %>%
  addImageQuery(r, type="mousemove", layerId = "values")

将其放入闪亮的应用程序中，您将获得：

library(raster)
library(mapview)
library(leaflet)
library(shiny)

f <- system.file("external/test.grd", package="raster")
r <- raster(f)

ui <- fluidPage(
  leafletOutput("map")
)

server <- function(input, output){
  output$map <- renderLeaflet({
    leaflet() %>% 
      addRasterImage(r, layerId = "values") %>% 
      addMouseCoordinates() %>%
      addImageQuery(r, type="mousemove", layerId = "values")
  })
}

shinyApp(ui, server)

下面的示例说明了将栅格转换为简单要素/ Shapefile的想法。它不适用于大型文件，但标签可以单独设计，数据是可编辑的，并且可以轻松地显示在表格中。

library(raster)
library(leaflet)
library(shiny)
library(sf)
library(DT)
library(dplyr)

## DATA
f <- system.file("external/test.grd", package="raster")
r <- raster(f)
r1 = aggregate(r, 30)

sp = st_as_sf(rasterToPolygons(r1))
cn = st_coordinates(st_transform(st_centroid(sp),4326))
sp = st_transform(sp, 4326)
sp = cbind(sp, cn)
sp$id <- 1:nrow(sp)
colnames(sp)[1] <- "value"


## UI
ui <- fluidPage(
  leafletOutput("map"),
  uiOutput("newValueUI"),
  textInput("newVal", label = "Enter new value"),
  actionButton("enter", "Enter new value"),
  hr(),
  dataTableOutput("table")
)


## SERVER
server <- function(input, output){

  ## Reactive Shapefile
  sp_react <- reactiveValues(sp = sp)

  ## Leaflet Map
  output$map <- renderLeaflet({
    pal= colorNumeric(topo.colors(25), sp_react$sp$value)
    leaflet() %>% 
      addPolygons(data = sp_react$sp, label= paste(
        "Lng: ", as.character(round(sp_react$sp$X,4)),
        "Lat: ", as.character(round(sp_react$sp$Y,4)),
        "Val: ", as.character(round(sp_react$sp$value,4))),
        color = ~pal(sp_react$sp$value), 
        layerId = sp_react$sp$id
      )
  })

  ## Observe Map Clicks
  observeEvent(input$map_shape_click, {

    click_id = input$map_shape_click$id

    click_grid <- sp_react$sp[sp_react$sp$id == click_id,]

  })

  ## Observe Action Button
  observeEvent(input$enter, {
    click_id <- input$map_shape_click$id
    sp_react$sp[sp_react$sp$id == click_id,]$value <- as.numeric(input$newVal)
  })

  ## Data Table
  output$table <- DT::renderDataTable({
    sp_react$sp %>% st_set_geometry(NULL) %>% 
      dplyr::select(id,X,Y,value)
  })
  proxy = dataTableProxy('table')

  ## Table Proxy
  observeEvent(input$map_shape_click$id, {
    req(input$map_shape_click$id)
    proxy %>% selectRows(as.numeric(input$map_shape_click$id))
  })
}

shinyApp(ui, server)