R-用apply系列中的函数替换双循环

Question

我有这些循环：

xall = data.frame()
for (k in 1:nrow(VectClasses))
{
for (i in 1:nrow(VectIndVar))
  {
   xall[i,k] = sum(VectClasses[k,] == VectIndVar[i,])
  }
}

数据：

VectClasses =包含每个类别特征的数据框

VectIndVar =包含数据库的每个记录的数据框

这两个for循环可以工作并提供我可以使用的输出，但是，这花费的时间太长，因此我需要Apply系列

我正在寻找的输出是这样的：

    V1 V2 V3 V4
 1  3  3  2  2
 2  2  2  1  1
 3  3  4  3  3
 4  3  4  3  3
 5  4  4  3  3
 6  3  2  3  3

我尝试使用：

xball = data.frame()
xball = sapply(xball, function (i,k){
 sum(VectClasses[k,] == VectIndVar[i,])})

xcall = data.frame()
xcall = lapply(xcall, function (i, k){sum(VectClasses[k,] == VectIndVar[i,]} )

但似乎都没有填充数据框

生殖数据（缩短）：

VectIndVar <- data.frame(a=sample(letters[1:5], 100, rep=T), b=floor(runif(100)*25), 
 c = sample(c(1:5), 100, rep=T), 
 d=sample(c(1:2), 100, rep=T))

和：

> K1 = 4
VectClasses= VectIndVar [sample(1:nrow(VectIndVar ), K1, replace=FALSE), ]

你能帮助我吗？

Answer 1

我会使用outer而不是*apply：

res <- outer( 
  1:nrow(VectIndVar), 
  1:nrow(VectClasses),
  Vectorize(function(i,k) sum(VectIndVar[i,-1]==VectClasses[k,-1]))
)

（感谢此问答，以澄清Vectorize需要的内容。）

这给

> head(res) # with set.seed(1) before creating the data
     [,1] [,2] [,3] [,4]
[1,]    1    1    2    1
[2,]    0    0    1    0
[3,]    0    0    0    0
[4,]    0    0    1    0
[5,]    1    0    0    1
[6,]    1    1    1    1

至于速度，我建议使用矩阵而不是data.frames：

cmat <- as.matrix(VectClasses[-1]); rownames(cmat)<-VectClasses$a
imat <- as.matrix(VectIndVar[-1]);  rownames(imat)<-VectIndVar$a