Phy*_*ist 4 linear-algebra vectorization scipy multidimensional-array least-squares
我需要解决一个线性方程组Lx = b,其中x始终是一个向量(3x1数组),L是一个Nx3数组,b是一个Nx1向量。N通常在4到10之类的范围内。
scipy.linalg.lstsq(L,b)
但是,我需要做很多次(大约200x200 = 40000次),因为x实际上是与图像中每个像素相关联的东西。因此,x实际上存储在PxQx3数组中,其中P和Q类似于200-300,最后一个数字“ 3”表示向量x。现在,我只遍历每一行每一行,并逐一求解方程。如何有效地求解那些40000个不同的线性方程组,可能使用某些矢量化技术或其他特殊方法?
谢谢
通过使用例程的矩阵堆栈功能,可以提高速度numpy.linalg。这不适用于numpy.linalg.lstsq,但是numpy.linalg.svd可以,因此您可以自己实现lstsq:
import numpy as np
def stacked_lstsq(L, b, rcond=1e-10):
"""
Solve L x = b, via SVD least squares cutting of small singular values
L is an array of shape (..., M, N) and b of shape (..., M).
Returns x of shape (..., N)
"""
u, s, v = np.linalg.svd(L, full_matrices=False)
s_max = s.max(axis=-1, keepdims=True)
s_min = rcond*s_max
inv_s = np.zeros_like(s)
inv_s[s >= s_min] = 1/s[s>=s_min]
x = np.einsum('...ji,...j->...i', v,
inv_s * np.einsum('...ji,...j->...i', u, b.conj()))
return np.conj(x, x)
def slow_lstsq(L, b):
return np.array([np.linalg.lstsq(L[k], b[k])[0]
for k in range(L.shape[0])])
def test_it():
b = np.random.rand(1234, 3)
L = np.random.rand(1234, 3, 6)
x = stacked_lstsq(L, b)
x2 = slow_lstsq(L, b)
# Check
print(x.shape, x2.shape)
diff = abs(x - x2).max()
print("difference: ", diff)
assert diff < 1e-13
test_it()
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
一些时间表明,对于该问题大小,堆叠版本的速度大约是此处的6倍。麻烦是否值得取决于问题。