jan*_*cki 18 r data.table r6
我能以某种方式通过参考原子矢量使用子分配吗?
当然没有将它包装在1列data.table中使用:=.
library(data.table)
N <- 5e7
x <- sample(letters, N, TRUE)
X <- data.table(x = x)
upd_i <- sample(N, 1L, FALSE)
system.time(x[upd_i] <- NA_character_)
# user system elapsed
# 0.11 0.06 0.17
system.time(X[upd_i, x := NA_character_])
# user system elapsed
# 0.00 0.00 0.03
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如果R6可以提供帮助,那我就开放R6解决方案,因为它已经是我的一个解决方案了.
我已经检查过<-内部R6对象仍然会复制:gist.
在最新的R版本(3.1-3.1.2 +左右)中,对向量的赋值不会复制.你不会通过运行OP的代码来看到它,原因如下.因为您重复使用x并将其分配给其他对象,所以R不会被通知x在该点被复制,并且必须假定它不会(在上面的特定情况下,我认为将其更改为data.table::data.table并通知R已经制作了副本,但这是一个单独的问题 - data.frame遭受同样的问题),并且因为它x在第一次使用时复制.如果你稍微改变命令的顺序,你会发现没有区别:
N <- 5e7
x <- sample(letters, N, TRUE)
upd_i <- sample(N, 1L, FALSE)
# no copy here:
system.time(x[upd_i] <- NA_character_)
# user system elapsed
# 0 0 0
X <- data.table(x = x)
system.time(X[upd_i, x := NA_character_])
# user system elapsed
# 0 0 0
# but now R will copy:
system.time(x[upd_i] <- NA_character_)
# user system elapsed
# 0.28 0.08 0.36
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(旧答案,大部分是好奇心)
你实际上可以使用data.table :=运算符来修改你的向量(我认为你需要R版本3.1+以避免副本list):
modify.vector = function (v, idx, value) setDT(list(v))[idx, V1 := value]
v = 1:5
address(v)
#[1] "000000002CC7AC48"
modify.vector(v, 4, 10)
v
#[1] 1 2 3 10 5
address(v)
#[1] "000000002CC7AC48"
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正如@Frank所建议的那样,使用它可以做到这一点Rcpp.这是一个包含受Rcpp启发的宏的版本dispatch.h,它处理所有原子向量类型:
mod_vector.cpp
#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;
template <int RTYPE>
Vector<RTYPE> mod_vector_impl(Vector<RTYPE> x, IntegerVector i, Vector<RTYPE> value) {
if (i.size() != value.size()) {
stop("i and value must have same length.");
}
for (int a = 0; a < i.size(); a++) {
x[i[a] - 1] = value[a];
}
return x;
}
#define __MV_HANDLE_CASE__(__RTYPE__) case __RTYPE__ : return mod_vector_impl(Vector<__RTYPE__>(x), i, Vector<__RTYPE__>(value));
// [[Rcpp::export]]
SEXP mod_vector(SEXP x, IntegerVector i, SEXP value) {
switch(TYPEOF(x)) {
__MV_HANDLE_CASE__(INTSXP)
__MV_HANDLE_CASE__(REALSXP)
__MV_HANDLE_CASE__(RAWSXP)
__MV_HANDLE_CASE__(LGLSXP)
__MV_HANDLE_CASE__(CPLXSXP)
__MV_HANDLE_CASE__(STRSXP)
__MV_HANDLE_CASE__(VECSXP)
__MV_HANDLE_CASE__(EXPRSXP)
}
stop("Not supported.");
return x;
}
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例:
x <- 1:20
address(x)
#[1] "0x564e7e8"
mod_vector(x, 4:5, 12:13)
# [1] 1 2 3 12 13 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
address(x)
#[1] "0x564e7e8"
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与base和data.table方法比较.可以看出它快得多:
x <- 1:2e7
microbenchmark::microbenchmark(mod_vector(x, 4:5, 12:13), x[4:5] <- 12:13, modify.vector(x, 4:5, 12:13))
#Unit: microseconds
# expr min lq mean median uq
# mod_vector(x, 4:5, 12:13) 5.967 7.3480 15.05259 9.718 21.0135
# x[4:5] <- 12:13 2.953 5.3610 45722.61334 48122.996 52623.1505
# modify.vector(x, 4:5, 12:13) 954.577 988.7785 1177.17925 1021.380 1361.1210
# max neval
# 58.463 100
# 126978.146 100
# 1559.985 100
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